LDB3 - LDB3
LIM домена связывания 3 ( LDB3 ), также известный как Z-группа альтернативного сплайсинга PDZ-мотив ( ZASP ), представляет собой белок , который у человека кодируется LDB3 гена . ZASP принадлежит к подсемейству белков Enigma и стабилизирует саркомер (основные единицы мышц) во время сокращения посредством взаимодействия с актином в сердечных и скелетных мышцах . Мутации в гене ZASP связаны с несколькими мышечными заболеваниями .
Состав
ZASP представляет собой белок, содержащий домен PDZ . Мотивы PDZ представляют собой модульные домены белок-белкового взаимодействия, состоящие из 80-120 аминокислотных остатков. Белки, содержащие домен PDZ, взаимодействуют друг с другом в сборке цитоскелета или с другими белками, участвующими в нацеливании и кластеризации мембранных белков. ZASP взаимодействует с альфа- актинином -2 через свой N-концевой домен PDZ и с протеинкиназой C через свои C-концевые домены LIM . Домен LIM представляет собой богатый цистеином мотив, состоящий из 50-60 аминокислот, содержащий два цинк-связывающих модуля. Этот белок также взаимодействует со всеми тремя членами семейства миозенинов .
ZASP человека может существовать в клетках сердца и скелета в виде шести различных изоформ, основанных на альтернативном сплайсинге 16 экзонов. Существует 2 короткие формы ZASP (Uniprot ID: O75112-6, 31,0 кДа, 283 аминокислоты; и Uniprot ID: O75112-5, 35,6 кДа, 330 аминокислот); и 4 длинные формы ZASP (Uniprot ID: O75112-4, 42,8 кДа, 398 аминокислот; Uniprot ID: O75112-3, 50,6 кДа, 470 аминокислот; Uniprot ID: O75112-2, 66,6 кДа, 617 аминокислот; и Uniprot ID: O75112, 77,1 кДа, 727 аминокислот). Все изоформы ZASP имеют N-концевой домен PDZ ; внутренние консервативные последовательности, известные как ZASP-подобные мотивы (ZM); и четыре длинные изоформы имеют три C-концевых домена LIM .
Функция
ZASP поддерживает структурную целостность саркомеров во время сокращения и, как было показано, участвует в передаче сигналов протеинкиназы А. Также было показано, что ZASP совместно с белком TLN1 активирует интегрины α5β1 .
Клиническое значение
Мутации в ZASP были связаны с миофибриллярной миопатией , дилатационной кардиомиопатией , аритмогенной кардиомиопатией правого желудочка , некомпактной кардиомиопатией и мышечной дистрофией .
Взаимодействия
Домен PDZ из ZASP связывает С-концом из альфа-актинина 2 и Z связывают домен стержня альфа-актинина 2 . В LIM домены было показано , что взаимодействие с протеинкиназы С . Сердечно-специфичная область ZASP , кодируемый экзон 4 включает в себя ZP мотива и связывает регуляторная субъединица протеинкиназы .
Смотрите также
Рекомендации
дальнейшее чтение
- Марзилиано Н., Маннарино С., Несполи Л., Диеголи М., Пасотти М., Малаттиа С. и др. (Май 2007 г.). «Синдром Барта, связанный с сложной гемизиготностью и гетерозиготностью генов TAZ и LDB3». Американский журнал медицинской генетики Часть А . 143А (9): 907–15. DOI : 10.1002 / ajmg.a.31653 . hdl : 2434/45968 . PMID 17394203 . S2CID 20328643 .
- Клаавуниеми Т., Юленне Дж. (Май 2006 г.). «Фрагменты, содержащие внутренний ZM-мотив Zasp / Cypher, достаточны для совместной локализации с альфа-актинином - анализ мутаций пациента». Экспериментальные исследования клеток . 312 (8): 1299–311. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2005.12.036 . PMID 16476425 .
- Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р. и др. (Январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Фрей Н., Олсон Э. Н. (апрель 2002 г.). «Кальсарцин-3, новый специфический для скелетных мышц член семейства кальсарцинов, взаимодействует с множеством белков Z-диска» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13998–4004. DOI : 10.1074 / jbc.M200712200 . PMID 11842093 .
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
- Пассье Р., Ричардсон Дж. А., Олсон Е. Н. (апрель 2000 г.). «Oracle, новый белок домена PDZ-LIM, экспрессируемый в сердце и скелетных мышцах» . Механизмы развития . 92 (2): 277–84. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (99) 00330-5 . PMID 10727866 . S2CID 18254892 .
- Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 5 (3): 169–76. DOI : 10.1093 / dnares / 5.3.169 . PMID 9734811 .
- Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D и др. (Январь 1996 г.). «Идентификация 4370 экспрессируемых тегов последовательности из библиотеки кДНК, специфичной для 3'-конца скелетных мышц человека, путем секвенирования ДНК и гибридизации с фильтром» . Геномные исследования . 6 (1): 35–42. DOI : 10.1101 / gr.6.1.35 . PMID 8681137 .
Внешние ссылки
- GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о миофибриллярной миопатии
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75112 (человеческий белок, связывающий домен LIM 3) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9JKS4 (мышиный домен, связывающий домен LIM 3) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .