Белок связывающего РНК-мотива, Y-связанный, семейство 1, член A1 - RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1

RBMY1A1
Доступные конструкции
PDB	Поиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2FY1
Идентификаторы
Псевдонимы	RBMY1A1 , RBM, RBM1, RBM2, RBMY, RBMY1C, YRRM1, YRRM2, белок РНК-связывающего мотива, Y-связанный, семейство 1, член A1, белок РНК-связывающего мотива, Y-связанный член семейства 1, член A1
Внешние идентификаторы	OMIM : 400006 HomoloGene : 121598 GeneCards : RBMY1A1
Расположение гена ( человек )
Chr.	Y-хромосома (человек)
Конец	21 549 326 п.н.
Онтология генов
Молекулярная функция	• Связывание с белком GO: 0001948 ; • Связывание мРНК ; • Связывание РНК ; • Связывание нуклеиновой кислоты;
Сотовый компонент	• ядро ; • ядерное пятнышко;
Биологический процесс	• процессинг мРНК ; • регулирование альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы ; • сплайсинг РНК ; • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	5940
	н / д
	ENSG00000234414
	н / д
	P0DJD3
	н / д
	NM_005058 ; NM_001320944 ; NM_001320945
	н / д
NP_001307873 ; NP_001307874 ; NP_005049 ; NP_001006120 ; NP_001307878;
	NP_001307879
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека

РНК-связывающий белок мотив, Y - хромосому, семейство 1 член A1 / C представляет собой белок , который у человека кодируется RBMY1A1 гена .

Этот ген кодирует белок, содержащий РНК-связывающий мотив на N-конце и четыре блока SRGY (серин, аргинин, глицин, тирозин) на С-конце . Несколько копий этого гена найдены в AZFb азооспермии фактор области хромосомы Y и кодируемый белок , как полагают, участвует в сперматогенезе . Большинство копий этого локуса являются псевдогенами , хотя шесть очень похожих копий имеют полноразмерные ORF и считаются функциональными. Четыре функциональные копии этого гена обнаружены в инвертированном повторе IR2; две функциональные копии этого гена обнаружены в палиндроме P3, а также две копии PTPN13-подобного, Y-сцепленного. Альтернативный сплайсинг транскриптов приводит к двум вариантам транскриптов, которые кодируют разные белки.

использованная литература

дальнейшее чтение

Лавери Р., Гленнон М., Хоутон Дж. И др. (2007). «Исследование экспрессии генов DAZ и RBMY1 в семенниках человека с помощью количественной ПЦР в реальном времени» . Arch. Андрол . 53 (2): 71–3. DOI : 10.1080 / 01485010600915228 . PMID 17453684 .
Скрисовская Л., Буржуа К.Ф., Стефл Р. и др. (2007). «Человеческий белок RBMY, специфичный для семенников, распознает РНК с помощью нового способа взаимодействия» . EMBO Rep . 8 (4): 372–9. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400910 . PMC 1852761 . PMID 17318228 .
Линдтнер С., Золотухин А.С., Ураниши Х. и др. (2007). «РНК-связывающий мотив белка 15 связывается с транспортным элементом РНК RTÉ и обеспечивает прямую связь с путем экспорта NXF1» . J. Biol. Chem . 281 (48): 36915–28. DOI : 10.1074 / jbc.M608745200 . PMID 17001072 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Цуэй DJ, Сюй Х.С., Ли PH и др. (2004). «RBMY, специфический для мужских зародышевых клеток РНК-связывающий белок, активируемый при раке печени человека и трансформирующий фибробласты грызунов» . Онкоген . 23 (34): 5815–22. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207773 . PMID 15184870 .
Скалецкий Х., Курода-Кавагути Т., Минкс П.Дж. и др. (2003). «Специфическая для мужчин область Y-хромосомы человека представляет собой мозаику классов дискретных последовательностей» . Природа . 423 (6942): 825–37. Bibcode : 2003Natur.423..825S . DOI : 10,1038 / природа01722 . PMID 12815422 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Цуэй DJ, Чанг М.Х., Чен П.Дж. и др. (2003). «Характеристика моделей интеграции и фланкирующих клеточных последовательностей вируса гепатита В в гепатоцеллюлярных карциномах у детей». J. Med. Virol . 68 (4): 513–21. DOI : 10.1002 / jmv.10240 . PMID 12376959 . S2CID 26869562 .
Фрил А., Хоутон Дж. А., Гленнон М. и др. (2002). «Предварительный отчет о значении RT-PCR обнаружения мРНК DAZ, RBMY1, USP9Y и Protamine-2 в образцах биопсии яичек от мужчин с азооспермией» . Int. Дж. Андрол . 25 (1): 59–64. DOI : 10.1046 / j.1365-2605.2002.00326.x . PMID 11869379 .
Пеллиццони Л., Шарру Б., Раппсилбер Дж. И др. (2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом выживания мотонейрона и РНК-полимеразой II» . J. Cell Biol . 152 (1): 75–85. DOI : 10,1083 / jcb.152.1.75 . PMC 2193649 . PMID 11149922 .
Эллиотт Д.Д., Буржуа К.Ф., Клинк А. и др. (2000). «РНК-связывающий белок, специфичный для зародышевых клеток млекопитающих, взаимодействует с повсеместно экспрессируемыми белками, участвующими в выборе сайта сплайсинга» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (11): 5717–22. Bibcode : 2000PNAS ... 97.5717E . DOI : 10.1073 / pnas.97.11.5717 . PMC 18499 . PMID 10823932 .
Венейблс Дж. П., Эллиотт Д. Д., Макарова О. В. и др. (2000). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг» . Гм. Мол. Genet . 9 (5): 685–94. DOI : 10.1093 / HMG / 9.5.685 . PMID 10749975 .
Эллиотт Д.Д., Огене К., Макаров Г. и др. (1998). «Динамические изменения в субядерной организации белков сплайсинга пре-мРНК и RBM во время развития зародышевых клеток человека». J. Cell Sci . 111 (9): 1255–65. DOI : 10,1242 / jcs.111.9.1255 . PMID 9547301 .
Проссер Дж., Инглис Дж. Д., Конди А. и др. (1997). «Вырождение в человеческой многокопийной RBM (YRRM), кандидатный ген сперматогенеза». Мамм. Геном . 7 (11): 835–42. DOI : 10.1007 / s003359900246 . PMID 8875892 . S2CID 23907707 .

Эта статья о белках незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Languages

In other projects

Белок связывающего РНК-мотива, Y-связанный, семейство 1, член A1 - RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1

использованная литература

дальнейшее чтение