Полипиримидиновый тракт - Polypyrimidine tract

Существенный компонент сплайсосомы U2AF связывается с коротким полипиримидиновым фрагментом РНК.

Полипиримидиновых тракт представляет собой область предварительно матричной РНК (мРНК) , что способствует сборка сплайсосома , в белке комплексной специализированной для проведения сплайсинга РНК в процессе пост-транскрипционной модификации . Область богата пиримидиновые нуклеотиды , особенно урацил , и, как правило , 15-20 пар оснований в длину, расположенные около 5-40 пар оснований до 3' конца от интрона , подлежащие сращиванию.

Ряд белковых факторов связывается с полипиримидиновым трактом или ассоциируется с ним, включая сплайсосомный компонент U2AF и белок, связывающий полипиримидиновый тракт (PTB), который играет регулирующую роль в альтернативном сплайсинге . Основная функция PTB находится в экзона глушителей, с помощью которого конкретный экзон область обычно сплайсинга мРНК в зрелом вместо этого опущены, в результате экспрессии в качестве изоформы белка , для которых мРНК кодов . Поскольку PTB повсеместно экспрессируется у многих высших эукариот , считается, что он подавляет включение «слабых» экзонов с плохо определенными сайтами сплайсинга . Однако связывания PTB недостаточно для подавления «устойчивых» экзонов.

Подавление или отбор экзонов имеет решающее значение для правильной экспрессии тканеспецифичных изоформ. Напр., Гладкие мышцы и скелетные мышцы экспрессируют альтернативные изоформы, отличающиеся взаимоисключающим отбором экзонов в альфатропомиозине .

Ссылки

  1. ^ Лодиш Н, Берк А, Мацудаир Р, Кайзер СА, Krieger М, Скотт М. П., Zipursky С. Л., Дарнелл Дж (2004). Молекулярная клеточная биология. WH Freeman: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. 5-е изд.
  2. ^ Вагнер EJ, Гарсия-Бланко MA. (2001). Связывающий белок полипиримидинового тракта препятствует определению экзона. Mol Cell Biol 21 (10): 3281-3288.
  3. Перейти ↑ Gooding C, Roberts GC, Smith CW. (1998). Роль ингибирующего пиримидинового элемента и связывающего белка полипиримидинового тракта в репрессии регулируемого экзона альфа-тропомиозина. РНК 4: 85-100.
  4. Перейти ↑ Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). Плавное специфичное для мышц переключение альфа-тропомиозина, взаимоисключающий отбор экзона путем специфического ингибирования сильного экзона по умолчанию. EMBO J 13 (16): 3861-72.