Гаплогруппа HV (мтДНК) - Haplogroup HV (mtDNA)

Гаплогруппа HV
Возможное время происхождения > 24 тыс. Лет назад
Возможное место происхождения Западная Азия ( Ближний Восток или Кавказ )
Предок R0
Потомки HV0, HV1, HV2, HV3, HV4, HV5, H
Определение мутаций T14766C

Гаплогруппа HV - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК).

Источник

Гаплогруппа HV происходит от гаплогруппы R0 , который , в свою очередь спускается с гаплогруппы R . HV также наследственные клады к гаплогруппам H и V .

Распределение

Гаплогруппа HV встречается в основном в Западной Азии , Центральной Азии , Южной Европе , Восточной Европе и Северной Африке .

В Африке наибольшая доля клады приходится на египтян, населяющих оазис Эль-Хайез (14,3%). субклад HV0 встречается среди мозабитских берберов (8,24%), ливийцев (7,4%), регибате- сахрави (6,48%), берберов Зенаты (5,48%) и алжирцев (всего 4,84%; в Оране 2,15–3,75% ).

В исследовании, опубликованном в 2013 году, гаплогруппа HV (xHV0, H) была обнаружена у большого процента населения в Афганистане : 11,0% (14/127) узбеков (включая 1/127 HV2 и 1/127 HV6), 8,2% (12 / 146) таджикский (включая 3/146 HV6 и 1/146 HV2), 8,0% (6/75) туркменский (включая 1/75 HV2), 6,4% (5/78) хазарейский и 5,6% (5/90) пуштунский . Кроме того, гаплогруппа HV0 была обнаружена у 1,4% (2/146) выборки афганских таджиков, но неясно, принадлежат ли они к субкладу гаплогруппы V. Субклад HV1a1a был обнаружен у 1,8% (3/169) якутов в одном исследовании и у 1,2% (5/423) якутов в другом исследовании, опубликованном в 2013 году.

В 2003 году было опубликовано исследование, в котором сообщалось о секвенировании мтДНК костей двух 24000-летних анатомически современных людей кроманьонского типа из южной Италии . Исследование показало, что один из них принадлежал к гаплогруппе HV или R0. Гаплогруппа HV также была обнаружена среди древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом доптолемеев / позднего Нового царства , птолемеев и римлян .

Гаплогруппа HV была обнаружена в различных окаменелостях, которые были проанализированы на предмет наличия древней ДНК, включая образцы, связанные с линейной керамикой Альфельда (HV, Mezőkövesd-Mocsolyás, 1/3 или 33%), Linearbandkeramik (HV0a, Fajsz-Garadomb, 1/2 или 50%) и Германии среднего неолита (HV, Кведлинбург, 1/2 или 50%) культур.

Субклады

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов HV гаплогруппы основано на статье van Oven (2009) и Malyarchuk et al. (2008).

  • HV
    • HV0 (ранее известный как pre-V)
      • HV0a (ранее известный как preV * 2)
        • HV0a1
        • V
      • 195 (ранее известный как preV * 1)
        • HV0b
        • HV0c
    • HV1
      • HV1a
        • HV1a1
          • HV1a1a
        • HV1a2
      • HV1b
        • HV1b1
        • HV1b2
      • HV1c
    • 73
      • HV2
        • HV2a
    • HV4
      • HV4a
    • HV5
    • 16311 (ранее известный как HV3) (13 ± 2 тыс. Лет назад)
      • HV6 (ранее известный как HV3b) (15,4 ± 4,5 тыс. Лет назад)
        • HV6a (ранее известный как HV3b1)
      • HV7 (ранее известный как HV3c)
      • HV8 (ранее известный как HV3d)
      • HV9 (ранее известный как HV3a) (8,2 ± 2,9 тыс. Лет назад)
        • 152
          • HV9a
      • HV10
    • ЧАС

HV0 и HVSI C16298T

Определяя мутацию C / T в местоположении 16298 в сегменте I, один из гипервариабельных сегментов помечен как HV0 по состоянию на 2012 год. Процент людей, которые дали положительный результат на указанную выше мутацию в исследовании западноевропейских популяций в 2002 году, указан ниже.

численность населения #Нет % населения
Финляндия 50 12
Норвегия 323 4
Шотландия 874 4
Англия 262 3
Северная Германия 140 6
Южная Германия 266 5
Франция 213 3
Галиция 135 5
Северная Португалия 184 7
Центральная Португалия 162 3
Южная Португалия 196 4
Северная Африка 349 5

В исследовании русского и польского населения процент людей с положительным результатом теста на эту мутацию составил пять процентов для обеих популяций.

численность населения #Нет Процент
Польский 436 5
русский 201 5

Исследование иракцев обобщило ряд предыдущих исследований, показывающих низкие уровни этой мутации среди населения Ближнего Востока и Италии.

численность населения #Нет % населения
Иракский 216 0,5
Сирийский 69 2,9
Грузинский 139 0,7
Итальянский 99 5.1

Эта мутация была обнаружена в древней ДНК, полученной из одного из девятнадцати человеческих останков, обнаруженных на острове Готланд в Швеции, датированных 2800-2000 гг. До н.э. и археологически классифицированных как принадлежащие культуре ямочной керамики .

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

  Митохондриальная Ева ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E грамм Q   О А S р   я W Икс Y
C Z B F R0   pre-JT   п   U
HV JT K
ЧАС V J Т

использованная литература

  1. ^ Малярчук и др. (2008): «Основными компонентами среднего верхнего палеолита (26 000 YBP) были HV *, U1, возможно, U2 и U4, а основным компонентом раннего верхнего палеолита (45 000 YBP) была в основном гаплогруппа U5».
  2. ^ Малярчук и др. (2008): «Было высказано предположение, что большинство гаплогрупп HV, обнаруженных в настоящее время в Европе, происходят из региона Ближнего Востока и Кавказа (Richards et al. 2000; Tambets et al. 2000), но все еще остается много вопросов относительно классификации гаплогруппы, принадлежащие к семейству HV ".
  3. ^ а б Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Человеческая мутация . 30 (2): E386–94. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID  18853457 . S2CID  27566749 .
  4. ^ Мартина Куянова; Луиза Перейра; Вероника Фернандес; Жоана Б. Перейра; Виктор Черный (2009). "Ближневосточный неолитический генетический вклад в небольшой оазис египетской Западной пустыни". Американский журнал физической антропологии . 140 (2): 336–346. DOI : 10.1002 / ajpa.21078 . PMID  19425100 .
  5. ^ a b c d Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорайя Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая неоднородность в алжирских популяциях человека» . PLOS ONE . 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0138453 . PMC  4581715 . PMID  26402429 .; Стол S5
  6. ^ Карима Fadhlaoui-Zid; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке выявляет генетический разрыв в долине Нила» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 107–117. DOI : 10.1002 / ajpa.21472 . hdl : 10261/42802 . PMID  21312180 . Проверено 20 апреля 2016 года .
  7. ^ а б Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А. и др. (2013), «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов на евразийском субконтиненте». PLoS ONE 8 (10): e76748. DOI: 10.1371 / journal.pone.0076748
  8. ^ Дагган А. Т., Уиттен М., Виби В., Кроуфорд М., Буттоф А. и др. (2013), «Исследование предыстории тунгусских народов Сибири и Амуро-Уссурийского региона с помощью полных последовательностей генома мтДНК и маркеров Y-хромосомы». PLoS ONE 8 (12): e83570. DOI: 10.1371 / journal.pone.0083570
  9. ^ Сардана Федорова, Маэре Рейдла, Эне Мецпалу и др. , «Аутосомные и однопородные портреты коренного населения Саха (Якутия): значение для заселения Северо-Восточной Евразии». BMC Evolutionary Biology 2013, 13: 127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127
  10. ^ Карамелли, D; Lalueza-Fox, C; Вернези, К; Лари, М; Casoli, A; Mallegni, F; Кьярелли, B; Dupanloup, I; и другие. (2003). «Доказательства генетического разрыва между неандертальцами и 24 000-летними анатомически современными европейцами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (11): 6593–7. Bibcode : 2003PNAS..100.6593C . DOI : 10.1073 / pnas.1130343100 . PMC  164492 . PMID  12743370 .
  11. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение количества африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC  5459999 . PMID  28556824 .
  12. ^ Марк Липсон; и другие. (2017). «Параллельные палеогеномные трансекты раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских фермеров» . Природа . 551 (7680): 368–372. Bibcode : 2017Natur.551..368L . DOI : 10.1038 / nature24476 . PMC  5973800 . PMID  29144465 . Проверено 15 ноября 2017 года .
  13. ^ Малярчук, Б .; Grzybowski, T .; Деренко, М .; Перкова, М .; Vanecek, T .; Lazur, J .; Gomolcak, P .; Цыбовский, И. (2008). «Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (8): 1651–8. DOI : 10.1093 / molbev / msn114 . PMID  18477584 .
  14. ^ Сайт митохондриальной ДНК Гаплогруппы HV Яна Логана 2009
  15. ^ Малярчук и др. (2008): «Возраст слияния всего HV3, определяемый переходом в np 16311, составляет 12700 ± 1960 YBP. Однако следует отметить, что HV3 может быть полифилетическим из-за гипервариабельности np 16311. Между тем, подкластеры HV3a и HV3b вероятно, являются монофилетическими, и их возраст оценивается в 8 200 ± 2 900 и 15 420 ± 4500 YBP, соответственно. Однако для HV3b характерно высокое соотношение несинонимичных и синонимичных замен, поэтому возраст его коалесценции можно оценить как 11 837 ± 4 460 YBP, используя коэффициент предложено Kivisild et al. (2006) (таблица 2). То же самое, вероятно, верно и для оценки возраста гаплогруппы HV4 ".
  16. ^ Гонсалес, AM; Брем, А; Pérez, JA; Maca-Meyer, N; Флорес, К; Кабрера, В.М. (2003). «Сродство митохондриальной ДНК на атлантической окраине Европы». Американский журнал физической антропологии . 120 (4): 391–404. DOI : 10.1002 / ajpa.10168 . PMID  12627534 .
  17. ^ Малярчук, Б.А. Гжибовски, Т; Деренко, М.В.; Чарни, Дж; Возняк, М; Miścicka-Sliwka, D (2002). «Изменчивость митохондриальной ДНК у поляков и россиян». Анналы генетики человека . 66 (Pt 4): 261–83. DOI : 10.1046 / j.1469-1809.2002.00116.x . PMID  12418968 . S2CID  221424344 .
  18. ^ Аль-Захери, N; Семино, О; Бенуцци, G; Магри, C; Пассарино, G; Торрони, А; Сантачиара-Бенеречетти, А.С. (2003). «Полиморфизм Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения человека и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 458–72. DOI : 10.1016 / S1055-7903 (03) 00039-3 . PMID  12927131 .
  19. ^ Мальмстрём, Елена; Гилберт, М. Томас П .; Thomas, Mark G .; Брандстрём, Микаэль; Сторо, Ян; Мольнар, Петра; Андерсен, Пернилле К .; Бендиксен, Кристиан; и другие. (2009). «Древняя ДНК показывает отсутствие преемственности между неолитическими охотниками-собирателями и современными скандинавами» . Текущая биология . 19 (20): 1758–62. DOI : 10.1016 / j.cub.2009.09.017 . PMID  1978-1941 гг . S2CID  9487217 .

внешние ссылки