Киназа рецептора тропомиозина B - Tropomyosin receptor kinase B

НТРК2
Доступные конструкции
PDB	Ортолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4AT5 , 1HCF , 1WWB , 2MFQ , 4ASZ , 4AT3 , 4AT4
Идентификаторы
Псевдонимы	NTRK2 , GP145-TrkB, TRKB, trk-B, нейротрофический рецептор тирозинкиназы 2, OBHD, EIEE58
Внешние идентификаторы	OMIM : 600456 MGI : 97384 HomoloGene : 4504 GeneCard : NTRK2
Расположение гена ( человек )
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	85 027 070 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Chr.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	59 133 970 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• нейротрофины связывания ; • нейротрофинов активности рецептора ; • активность киназы ; • белковой активности тирозинкиназы трансмембранного рецептора ; • связывание АТФ ; • активности протеинкиназы ; • мозг нейротрофического фактор связывание ; • трансферазной активность ; • белки гомодимеризация активность ; • протеина - тирозин - киназы ; • нуклеотид связывание ; • мозг , полученный активность рецептора, активируемого нейротрофическим фактором ; • Связывание с белком GO: 0001948 ; • рецепторная тирозинкиназа ; • активность рецептора трансмембранной передачи сигналов;
Сотовый компонент	• цитозоль ; • эндосома ; • постсинаптическая мембрана ; • мембрана ; • терминальный бутон ; • интегральный компонент мембраны ; • рецепторный комплекс ; • мембрана эндосомы ; • интегральный компонент плазматической мембраны ; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность ; • ранняя эндосома ; • ранняя мембрана эндосомы ; • плазматическая мембрана ; • аксон ; • дендрит ; • перинуклеарная область цитоплазмы ; • цитоплазма ; • проекция клетки ; • дендритный шип ; • конец аксона ; • мембрана Гольджи;
Биологический процесс	• отрицательного регулирование нейрона апоптотического процесса ; • развитие периферического нервной системы нейрона ; • положительное регулирование белка фосфорилирования ; • олигодендроциты дифференциации ; • обучение ; • положительного регулирования axonogenesis ; • васкулогенез ; • фосфорилирование белка ; • Развитие центрального нервной системы нейрона ; • развитие нервно - мышечное соединение ; • Развитие стержня клеток сетчатки ; • циркадный ритм ; • пищевое поведение ; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase ; • положительная регуляция фосфорилирования пептидилсерина ; • сигнальный путь рецептора нейротрофического фактора головного мозга ; • регуляция белка передача сигналов киназы B ; • регуляция метаболического процесса ; • позитивная регуляция каскада MAPK ; • дифференцировка клеток ; • фосфорилирование ; • миграция нейронов ; • дифференцировка механорецепторов ; • развитие нервной системы ; • секреция глутамата ; • развитие сетчатки глаза камерного типа ; • дифференциация нейронов ; • развитие коры головного мозга ; • отрицательный r регуляция аноикиса ; • развитие многоклеточного организма ; • позитивная регуляция экспрессии генов ; • позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции ; • позитивная регуляция развития проекции нейронов ; • клеточный ответ на аминокислотный стимул ; • позитивная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы ; • фосфорилирование пептидил-тирозина ; • длительный -временная синаптическая потенциация ; • положительная регуляция сборки синапсов ; • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеин тирозинкиназы ; • аутофосфорилирование белка ; • транссинаптическая передача сигналов нейропептидом, модуляция синаптической передачи ; • активация активности фосфолипазы C ; • сигнальный путь нейротрофинового рецептора TRK ; • позитивная регуляция не мембранная активность протеинтирозинкиназы ; • транс-синаптическая передача сигналов с помощью BDNF, модулирующая синаптическую передачу ; • негативная регуляция передачи сигнала ; • распространение потенциала нейронального действия ; • миелинизация в периферической нервной системе ; • негативная регуляция апоптоза c процесс ; • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 ; • клеточный ответ на стимул фактора роста нервов ; • регуляция каскада MAPK ; • клеточный ответ на стимул нейротрофического фактора мозга;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	4915
	18212
	ENSG00000148053
	ENSMUSG00000055254
	Q16620
	P15209
NM_001007097 ; NM_001018064 ; NM_001018065 ; NM_001018066 ; NM_001291937;
	NM_006180
	NM_001025074 ; NM_008745 ; NM_001282961
NP_001007098 ; NP_001018074 ; NP_001018075 ; NP_001018076 ; NP_001278866;
	NP_006171 ; NP_001356461 ; NP_001356462 ; NP_001356463 ; NP_001356464 ; NP_001356465 ; NP_001356466 ; NP_001356467 ; NP_001356468 ; NP_001356469 ; NP_001356470 ; NP_001356471 ; NP_001356472 ; NP_001356473 ; NP_001356474 ; NP_001356475 ; NP_001356476 ; NP_001356477 ; NP_001356478 ; NP_001356479 ; NP_001356480 ; NP_001356481
	NP_001020245 ; NP_001269890 ; NP_032771
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Тропомиозин рецептора киназы B ( TrkB ), также известный как рецептор тирозин - киназы B , или BDNF / НТ-3 рецепторов факторов роста или нейротрофический тирозинкиназы, рецептор, типа 2 представляет собой белок , который у человека кодируется NTRK2 гена . TrkB является рецептором нейротрофического фактора головного мозга (BDNF). Стандартное произношение - «следовая пчела».

Функция

Киназа B рецептора тропомиозина представляет собой каталитический рецептор с высоким сродством для нескольких « нейротрофинов », которые представляют собой небольшие белковые факторы роста, которые вызывают выживание и дифференциацию отдельных популяций клеток. Нейротрофины, активирующие TrkB, это: BDNF ( нейротрофический фактор мозга), нейротрофин-4 (NT-4) и нейротрофин-3 (NT-3). Таким образом, TrkB опосредует множественные эффекты этих нейротрофических факторов, включая дифференцировку и выживание нейронов. Исследования показали, что активация рецептора TrkB может привести к подавлению регуляции транспортера хлорида KCC2 в клетках ЦНС.

Рецептор TrkB является частью большого семейства рецепторных тирозинкиназ. А «тирозин киназы » представляет собой фермент , который способен добавлять фосфатную группу к определенным тирозинов на белки - мишени, или «субстратов». Рецепторная тирозинкиназа представляет собой «тирозинкиназу», которая расположена на клеточной мембране и активируется связыванием лиганда с внеклеточным доменом рецептора. Другие примеры рецепторов тирозинкиназы включают рецептор инсулина, рецептор IGF1, рецептор белка MuSK, рецептор фактора роста эндотелия сосудов (или VEGF) и т. Д.

Сигнализация TrkB

В настоящее время существует три изоформы TrkB в ЦНС млекопитающих. Полноразмерная изоформа (TK +) является типичным рецептором тирозинкиназы и передает сигнал BDNF через Ras-ERK, PI3K и PLCγ. Напротив, две усеченные изоформы (TK-: T1 и T2) обладают тем же внеклеточным доменом, трансмембранным доменом и первыми 12 внутриклеточными аминокислотными последовательностями, что и TK +. Однако С-концевые последовательности специфичны для изоформ (11 и 9 аминокислот соответственно). T1 имеет оригинальный сигнальный каскад, который участвует в регуляции морфологии клеток и притока кальция.

Члены семьи

TrkB является частью подсемейства протеинкиназ, которое также включает TrkA и TrkC . Существуют и другие нейротрофические факторы, структурно связанные с BDNF : NGF (для фактора роста нервов ), NT-3 (для нейротрофина-3) и NT-4 (для нейротрофина-4). В то время как TrkB опосредует эффекты BDNF, NT-4 и NT-3, TrkA связывается и, таким образом, активируется только NGF. Кроме того, TrkC связывается и активируется NT-3.

TrkB связывает BDNF и NT-4 сильнее, чем NT-3. TrkC связывает NT-3 сильнее, чем TrkB.

СПГФР

Помимо TrkB, существует еще один рецептор BDNF, называемый «LNGFR» (от « рецептора фактора роста нервов с низким сродством »). В отличие от TrkB, LNGFR играет несколько менее ясную роль в биологии BDNF. Некоторые исследователи показали, что LNGFR связывается и служит «стоком» для нейротрофинов. Следовательно, клетки, которые экспрессируют рецепторы LNGFR и Trk, могут обладать большей активностью, поскольку в них более высокая «микроконцентрация» нейротрофина. Однако также было показано, что LNGFR может сигнализировать клетке о смерти посредством апоптоза - поэтому клетки, экспрессирующие LNGFR в отсутствие рецепторов Trk, могут скорее погибнуть, чем жить в присутствии нейротрофина.

Роль в раке

Первоначально идентифицированный как онкогенное слияние в 1982 году, только недавно был возобновлен интерес к семейству Trk, поскольку оно связано с его ролью в раковых заболеваниях человека из-за идентификации NTRK1 (TrkA), NTRK2 (TrkB) и NTRK3 (TrkC). слияния генов и другие онкогенные изменения в ряде типов опухолей. Ряд ингибиторов Trk (в 2015 г.) проходит клинические испытания и уже на раннем этапе показал перспективу в уменьшении опухолей человека.

Как мишень для наркотиков

Энтректиниб (ранее RXDX-101) - исследуемый препарат, разработанный Ignyta, Inc., который обладает потенциальной противоопухолевой активностью. Это селективный ингибитор тирозинкиназы рецептора pan-trk (TKI), нацеленный на слияние генов в trkA , trkB (этот ген) и trkC (соответственно, кодируемый генами NTRK1 , NTRK2 и NTRK3 ), который в настоящее время проходит фазу 2 клинических испытаний.

Лиганды

Агонисты

3,7-дигидроксифлавон
3,7,8,2'-тетрагидроксифлавон
7,3'-дигидроксифлавон
7,8,2'-тригидроксифлавон
7,8,3'-тригидроксифлавон
Амитриптилин
БНН-20
Нейротрофический фактор головного мозга (BDNF)
Дезоксигедунин
Депренил
Диосметин
DMAQ-B1
Эвтропофлавин (4'-DMA-7,8-DHF)
HIOC
LM22A-4
N-ацетилсеротонин (НАС)
Нейротрофин-3 (NT-3)
Нейротрофин-4 (NT-4)
Норвогонин (5,7,8-THF)
R7 ( пролекарство тропофлавина)
R13 (пролекарство тропофлавина)
TDP6
Тропофлавин (7,8-ДГФ)

Антагонисты

Другие

Дегидроэпиандростерон (ДГЭА)

Взаимодействия

Было показано, что TrkB взаимодействует с:

Нейротрофический фактор головного мозга (BDNF),
FYN ,
NCK2 ,
PLCG1 ,
Секвестосома 1 и
SHC3 .

Смотрите также

Рецептор Trk

использованная литература

дальнейшее чтение

Кляйн Р., Конвей Д., Парада Л. Ф., Барбакид М. (май 1990 г.). «Ген тирозинкиназы trkB кодирует второй нейрогенный рецептор, в котором отсутствует каталитический домен киназы». Cell . 61 (4): 647–56. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90476-U . PMID 2160854 . S2CID 205020147 .
Squinto SP, Stitt TN, Aldrich TH, Davis S, Bianco SM, Radziejewski C, Glass DJ, Masiakowski P, Furth ME, Valenzuela DM (май 1991 г.). «trkB кодирует функциональный рецептор нейротрофического фактора мозга и нейротрофина-3, но не фактор роста нервов». Cell . 65 (5): 885–93. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90395-F . PMID 1710174 . S2CID 28853455 .
Роуз С.Р., Блюм Р., Пихлер Б., Лепье А., Кафиц К.В., Коннерт А. (ноябрь 2003 г.). «Усеченный TrkB-T1 опосредует вызванную нейротрофином передачу сигналов кальция в глиальных клетках». Природа . 426 (6962): 74–8. Bibcode : 2003Natur.426 ... 74R . DOI : 10,1038 / природа01983 . PMID 14603320 . S2CID 4432074 .
Охира К., Куманого Х., Сахара Й., Хомма К.Дж., Хираи Х., Накамура С., Хаяши М. (февраль 2005 г.). «Усеченный тропомиозин-родственный рецептор киназы B, T1, регулирует морфологию глиальных клеток через ингибитор 1 диссоциации Rho GDP» . J. Neurosci . 25 (6): 1343–53. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.4436-04.2005 . PMC 6725989 . PMID 15703388 .
Ямада К., Набешима Т. (2003). «Мозговой нейротрофический фактор / передача сигналов TrkB в процессах памяти» . J. Pharmacol. Sci . 91 (4): 267–70. DOI : 10,1254 / jphs.91.267 . PMID 12719654 .
Соппет Д., Эскандон Э, Марагос Дж., Миддлмас Д.С., Рид С.В., Блэр Дж., Бертон Л.Э., Стэнтон Б.Р., Каплан Д.Р., Хантер Т., Николикс К., Парада Л.Ф. (1991). «Нейротрофические факторы, нейротрофический фактор головного мозга и нейротрофин-3 являются лигандами для рецептора тирозинкиназы trkB». Cell . 65 (5): 895–903. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90396-G . PMID 1645620 . S2CID 37843818 .
Squinto SP, Stitt TN, Aldrich TH, Davis S, Bianco SM, Radziejewski C, Glass DJ, Masiakowski P, Furth ME, Valenzuela DM (1991). «trkB кодирует функциональный рецептор нейротрофического фактора мозга и нейротрофина-3, но не фактор роста нервов». Cell . 65 (5): 885–93. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90395-F . PMID 1710174 . S2CID 28853455 .
Ханиу М., Тальвенхеймо Дж., Ле Дж., Катта В., Велчер А., Роде М. Ф. (1995). «Внеклеточный домен рецептора нейротрофина trkB: дисульфидная структура, сайты N-гликозилирования и связывание лиганда». Arch. Biochem. Биофиз . 322 (1): 256–64. DOI : 10.1006 / abbi.1995.1460 . PMID 7574684 .
Ip NY, Ститт TN, Tapley P, Klein R, Glass DJ, Fandl J, Greene LA, Barbacid M, Yancopoulos GD (1993). «Сходства и различия в способе взаимодействия нейротрофинов с рецепторами Trk в нейрональных и ненейрональных клетках». Нейрон . 10 (2): 137–49. DOI : 10.1016 / 0896-6273 (93) 90306-C . PMID 7679912 . S2CID 46072027 .
Slaugenhaupt SA, Блюменфельд A, Либерт CB, Mull J, Lucente DE, Monahan M, Breakefield XO, Maayan C, Parada L, Axelrod FB (1995). «Человеческий ген нейротрофического рецептора тирозинкиназы типа 2 (NTRK2) расположен на хромосоме 9, но не является геном семейной дизавтономии». Геномика . 25 (3): 730–2. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80019-I . PMID 7759111 .
Шелтон Д.Л., Сазерленд Дж., Грипп Дж., Камерото Т., Арманини М.П., Филлипс Х.С., Кэрролл К., Спенсер С.Д., Левинсон А.Д. (1995). «Человеческие стволы: молекулярное клонирование, распределение тканей и экспрессия иммуноадгезинов внеклеточного домена» . J. Neurosci . 15 (1 Пет 2): 477–91. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.15-01-00477.1995 . PMC 6578290 . PMID 7823156 .
Аллен SJ, Dawbarn D, Eckford SD, Wilcock GK, Ashcroft M, Colebrook SM, Feeney R, MacGowan SH (1994). «Клонирование некаталитической формы человеческого trkB и распространение матричной РНК для trkB в человеческом мозге». Неврология . 60 (3): 825–34. DOI : 10.1016 / 0306-4522 (94) 90507-X . PMID 7936202 . S2CID 29288978 .
Риден М., Ибаньес К.Ф. (1996). «Связывание нейротрофина-3 с p75LNGFR, TrkA и TrkB опосредовано одним функциональным эпитопом, отличным от эпитопа, распознаваемого trkC» . J. Biol. Chem . 271 (10): 5623–7. DOI : 10.1074 / jbc.271.10.5623 . PMID 8621424 .
Ямамото М., Собуэ Г., Ямамото К., Терао С., Мицума Т. (1996). «Экспрессия мРНК нейротрофических факторов (NGF, BDNF, NT-3 и GDNF) и их рецепторов (p75NGFR, trkA, trkB и trkC) в периферической нервной системе взрослого человека и неневральных тканях». Neurochem. Res . 21 (8): 929–38. DOI : 10.1007 / BF02532343 . PMID 8895847 . S2CID 20559271 .
Валент А, Данглот Дж, Бернхейм А (1997). «Картирование рецепторов тирозинкиназы trkA (NTRK1), trkB (NTRK2) и trkC (NTRK3) на человеческие хромосомы 1q22, 9q22 и 15q25 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Евро. J. Hum. Genet . 5 (2): 102–4. DOI : 10.1159 / 000484742 . PMID 9195161 .
Ханиу М., Монтеструк С., Буреш Э.Дж., Тальвенхеймо Дж., Тосо Р., Льюис-Сэнди С., Велчер А.А., Роде М.Ф. (1997). «Взаимодействие между нейротрофическим фактором мозга и рецептором TRKB. Идентификация двух лигандсвязывающих доменов в растворимом TRKB путем разделения аффинности и химического перекрестного связывания» . J. Biol. Chem . 272 (40): 25296–303. DOI : 10.1074 / jbc.272.40.25296 . PMID 9312147 .
Накамура Т., Мураока С., Санокава Р., Мори Н. (1998). «N-Shc и Sck, два нейронально экспрессируемых гомолога адаптера Shc. Их дифференциальная региональная экспрессия в головном мозге и роль в передаче сигналов нейротрофина и Src» . J. Biol. Chem . 273 (12): 6960–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.12.6960 . PMID 9507002 .
Hackett SF, Friedman Z, Freund J, Schoenfeld C, Curtis R, DiStefano PS, Campochiaro PA (1998). «Вариант сплайсинга trkB и нейротрофического фактора головного мозга коэкспрессируются в пигментированных эпителиальных клетках сетчатки и способствуют дифференцированным характеристикам». Brain Res . 789 (2): 201–12. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (97) 01440-6 . PMID 9573364 . S2CID 1814445 .
Ивасаки Ю., Гей Б., Вада К., Коидзуми С. (1998). «Ассоциация тирозинкиназы Fyn семейства Src с TrkB». J. Neurochem . 71 (1): 106–11. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.1998.71010106.x . PMID 9648856 . S2CID 9012343 .
Цянь X, Риччио А., Чжан И, Гинти Д.Д. (1998). «Идентификация и характеристика новых субстратов рецепторов Trk в развивающихся нейронах» . Нейрон . 21 (5): 1017–29. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80620-0 . PMID 9856458 . S2CID 12354383 .
Бибель М, Хоппе Э, Барде Я. (1999). «Биохимические и функциональные взаимодействия между рецепторами нейротрофина trk и p75NTR» . EMBO J . 18 (3): 616–22. DOI : 10.1093 / emboj / 18.3.616 . PMC 1171154 . PMID 9927421 .
Ямада М., Охниши Х., Сано С., Араки Т., Накатани А., Икеучи Т., Хатанака Х (1999). «Нейротрофический фактор головного мозга стимулирует взаимодействия Shp2 с фосфатидилинозитол-3-киназой и Grb2 в культивируемых нейронах коры головного мозга». J. Neurochem . 73 (1): 41–9. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.1999.0730041.x . PMID 10386953 . S2CID 25333848 .
Ultsch MH, Wiesmann C, Simmons LC, Henrich J, Yang M, Reilly D, Bass SH, de Vos AM (1999). «Кристаллические структуры нейротрофин-связывающего домена TrkA, TrkB и TrkC». J. Mol. Биол . 290 (1): 149–59. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.2816 . PMID 10388563 .

внешние ссылки

Об этой молекуле вспоминают - New Scientist, 15 января 2007 г.

Languages

In other projects