Домен протеинкиназы - Protein kinase domain
| Домен протеинкиназы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура каталитической субъединицы цАМФ-зависимой протеинкиназы.
| |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Пкиназа | ||||||||
| Pfam | PF00069 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000719 | ||||||||
| УМНЫЙ | TyrKc | ||||||||
| ПРОФИЛЬ | PDOC00100 | ||||||||
| SCOP2 | 1apm / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 186 | ||||||||
| CDD | cd00180 | ||||||||
| Мембранома | 3 | ||||||||
| |||||||||
Домен протеинкиназы представляет собой структурно законсервирован домен белка , содержащий каталитическую функцию протеинкиназ . Протеинкиназы - это группа ферментов, которые перемещают фосфатную группу на белки в процессе, называемом фосфорилированием. Он функционирует как переключатель включения / выключения многих клеточных процессов, включая метаболизм, транскрипцию, развитие клеточного цикла, перестройку цитоскелета и движение клеток, апоптоз и дифференцировку. Они также участвуют в эмбриональном развитии, физиологических реакциях, нервной и иммунной системе. Аномальное фосфорилирование вызывает множество заболеваний человека, включая рак, и лекарства, влияющие на фосфорилирование, могут лечить эти заболевания.
Протеинкиназы обладают каталитической субъединицей, которая переносит гамма-фосфат от нуклеозидтрифосфатов (почти всегда АТФ ) в боковую цепь аминокислоты в белке, что приводит к конформационным и / или динамическим изменениям, влияющим на функцию белка. Эти ферменты делятся на два широких класса, характеризующихся субстратной специфичностью: специфичные для серина / треонина и специфичные для тирозина .
Функция
Функция протеинкиназы эволюционно сохранилась от Escherichia coli до Homo sapiens . Протеинкиназы играют роль во множестве клеточных процессов, включая деление, пролиферацию, апоптоз и дифференцировку. Фосфорилирование обычно приводит к функциональному изменению целевого белка за счет изменения структуры, динамики, активности ферментов, клеточного местоположения или ассоциации с другими белками.
Состав
Каталитические субъединицы протеинкиназ являются высококонсервативными, и были определены структуры более 270 из примерно 500 доменов киназ человека, что привело к большим скрининговым исследованиям для разработки специфичных к киназам ингибиторов для лечения ряда заболеваний.
Эукариотические протеинкиназы - это ферменты, которые принадлежат к очень обширному семейству белков, которые имеют общее консервативное каталитическое ядро, общее как с серин / треониновыми, так и с тирозиновыми протеинкиназами. Домен состоит из двух субдоменов, называемых N- и C-концевыми доменами. N-концевой домен состоит из пяти цепей бета-листов и альфа-спирали, называемой C-спиралью, а C-концевой домен обычно состоит из шести альфа-спиралей (обозначенных D, E, F, G, H и I). С-концевой домен содержит две длинные петли, называемые каталитической петлей и активационной петлей, которые необходимы для каталитической активности. Каталитическая петля включает «мотив HRD» (для аминокислотной последовательности His-Arg-Asp), остаток аспарагиновой кислоты которого взаимодействует непосредственно с гидроксильной группой целевого серина, треонина или остатка тирозина, который фосфорилируется.
Цикл активации начинается с мотива DFG (для аминокислотной последовательности Asp-Phe-Gly), который помогает связывать АТФ и магний в активном центре. В широком смысле состояние или конформация киназы можно классифицировать как DFGin или DFGout , в зависимости от того, находится ли остаток Asp в мотиве DFG в активном сайте или вне его. В активной форме первые несколько остатков петли активации принимают определенную форму конформации DFGin. Некоторые неактивные структуры могут принимать одну из нескольких других конформаций DFGin, в то время как другие неактивные структуры являются DFGout.
Примеры
Ниже приводится список белков человека, содержащих домен протеинкиназы:
AAK1 ; ААТК ; ABL1 ; ABL2 ; ACVR1 ; ACVR1B ; ACVR1C ; ACVR2A ; ACVR2B ; ACVRL1 ; АКТ1 ; АКТ2 ; АКТ3 ; ALK ; AMHR2 ; ANKK1 ; ВЛА ; АУРКА ; АУРКБ ; AURKC ; AXL ; BLK ; БМП2К ; BMPR1A ; BMPR1B ; BMPR2 ; BMX ; BRAF ; BRSK1 ; БРСК2 ; БТК ; BUB1 ; BUB1B ; CAMK1 ; CAMK1D ; CAMK1G ; CAMK2A ; CAMK2B ; CAMK2D ; CAMK2G ; CAMK4 ; CAMKK1 ; CAMKK2 ; CAMKV ; КАСКА ; CDC42BPA ; CDC42BPB ; CDC42BPG ; CDC7 ; CDK1 ; CDK10 ; CDK11A ; CDK11B ; CDK12 ; CDK13 ; CDK14 ; CDK15 ; CDK16 ; CDK17 ; CDK18 ; CDK19 ; CDK2 ; CDK20 ; CDK3 ; CDK4 ; CDK5 ; CDK6 ; CDK7 ; CDK8 ; CDK9 ; CDKL1 ; CDKL2 ; CDKL3 ; CDKL4 ; CDKL5 ; ЧЕК1 ; ЧЕК2 ; ЧУК ; CIT ; CLK1 ; CLK2 ; CLK3 ; CLK4 ; CSF1R ; ЦСК ; CSNK1A1 ; CSNK1A1L ; CSNK1D ; CSNK1E ; CSNK1G1 ; CSNK1G2 ; CSNK1G3 ; CSNK2A1 ; CSNK2A2 ; CSNK2A3 ; ДАПК1 ; DAPK2 ; DAPK3 ; DCLK1 ; DCLK2 ; DCLK3 ; DDR1 ; DDR2 ; ДМПК ; ДСТЫК ; DYRK1A ; DYRK1B ; DYRK2 ; DYRK3 ; DYRK4 ; EGFR ; EIF2AK1 ; EIF2AK2 ; EIF2AK3 ; EIF2AK4 ; EPHA1 ; EPHA10 ; EPHA2 ; EPHA3 ; EPHA4 ; EPHA5 ; EPHA6 ; EPHA7 ; EPHA8 ; EPHB1 ; EPHB2 ; EPHB3 ; EPHB4 ; EPHB6 ; ERBB2 ; ERBB3 ; ERBB4 ; ERN1 ; ERN2 ; FER ; ФЭС ; FGFR1 ; FGFR2 ; FGFR3 ; FGFR4 ; FGR ; FLT1 ; FLT3 ; FLT4 ; ФРК ; FYN ; ГАК ; GRK1 ; GRK2 ; GRK3 ; GRK4 ; GRK5 ; GRK6 ; GRK7 ; GSG2 ; GSK3A ; GSK3B ; GUCY2C ; GUCY2D ; GUCY2F ; HCK ; HIPK1 ; HIPK2 ; HIPK3 ; HIPK4 ; ХАНК; ICK ; IGF1R ; ИКБКБ ; ИКБКЕ ; ILK ; INSR ; INSRR ; IRAK1 ; IRAK2 ; IRAK3 ; IRAK4 ; ИТК ; JAK1 ; JAK2 ; JAK3 ; КАЛРН ; KDR ; КОМПЛЕКТ ; KSR1 ; КСР2 ; LATS1 ; LATS2 ; LCK ; LIMK1 ; LIMK2 ; LMTK2 ; LMTK3 ; LRRK1 ; LRRK2 ; ЛТК ; LYN ; МАК ; MAP2K1 ; MAP2K2 ; MAP2K3 ; MAP2K4 ; MAP2K5 ; MAP2K6 ; MAP2K7 ; MAP3K1 ; MAP3K10 ; MAP3K11 ; MAP3K12 ; MAP3K13 ; MAP3K14 ; MAP3K15 ; MAP3K19 ; MAP3K2 ; MAP3K20 ; MAP3K21 ; MAP3K3 ; MAP3K4 ; MAP3K5 ; MAP3K6 ; MAP3K7 ; MAP3K8 ; MAP3K9 ; MAP4K1 ; MAP4K2 ; MAP4K3 ; MAP4K4 ; MAP4K5 ; MAPK1 ; MAPK10 ; MAPK11 ; MAPK12 ; MAPK13 ; MAPK14 ; MAPK15 ; MAPK3 ; MAPK4 ; MAPK6 ; MAPK7 ; MAPK8 ; MAPK9 ; MAPKAPK2 ; MAPKAPK3 ; MAPKAPK5 ; MARK1 ; MARK2 ; MARK3 ; MARK4 ; MAST1 ; MAST2 ; MAST3 ; MAST4 ; МАСТЛ ; MATK ; MELK ; МЕРТК ; НДПИ ; MINK1 ; МКНК1 ; МКНК2 ; МЛКЛ ; МОК ; MOS ; MST1R ; MUSK ; MYLK ; MYLK2 ; MYLK3 ; MYLK4 ; MYO3A ; MYO3B ; NEK1 ; NEK10 ; NEK11 ; NEK2 ; NEK3 ; NEK4 ; NEK5 ; NEK6 ; NEK7 ; NEK8 ; NEK9 ; НИМ1К ; НЛК ; NPR1 ; NPR2 ; NRBP1 ; NRBP2 ; NRK ; НТРК1 ; НТРК2 ; НТРК3 ; NUAK1 ; NUAK2 ; OBSCN ; OXSR1 ; PAK1 ; PAK2 ; PAK3 ; PAK4 ; PAK5 ; PAK6 ; PAN3 ; ПАСК ; ПБК ; PDGFRA ; PDGFRB ; PDIK1L ; ПДПК1 ; PDPK2P ; PEAK1 ; PEAK3 ; PHKG1 ; PHKG2 ; ПИК3Р4 ; PIM1 ; PIM2 ; PIM3 ; PINK1 ; PKDCC ; PKMYT1 ; ПКН1 ; ПКН2 ; ПКН3 ; ПЛК1 ; ПЛК2 ; ПЛК3 ; ПЛК4 ; ПЛК5 ; PNCK ; ПОМК ; PRKAA1 ; PRKAA2 ; PRKACA ; PRKACB ; PRKACG ; PRKCA ; PRKCB ; PRKCD ; PRKCE ; PRKCG ; ПРКЧ ; PRKCI ; PRKCQ ; PRKCZ ; PRKD1 ; PRKD2 ; PRKD3 ; PRKG1 ; ПРКГ2 ; PRKX ; PRKY ; PRPF4B ; ПСХ1 ; ПСХ2 ; ПТК2 ; ПТК2Б ; ПТК6 ; ПТК7 ; PXK ; RAF1 ; RET ; РИОК1 ; РИОК2 ; РИОК3 ; РИПК1 ; РИПК2 ; РИПК3 ; РИПК4 ; RNASEL ; ROCK1 ; ROCK2 ; ROR1 ; ROR2 ; ROS1 ; RPS6KA1 ; РПС6КА2 ; RPS6KA3 ; RPS6KA4 ; РПС6КА5 ; RPS6KA6 ; РПС6КБ1 ; РПС6КБ2 ; RPS6KC1 ; РПС6КЛ1 ; РСКР ; RYK ; SBK1 ; SBK2 ; SBK3 ; SCYL1 ; SCYL2 ; SCYL3 ; SGK1 ; SGK2 ; SGK223 ; SGK3 ; SIK1 ; SIK1B ; SIK2 ; SIK3 ; SLK ; СНРК ; SPEG ; SRC ; SRMS ; СРПК1 ; СРПК2 ; СРПК3 ; STK10 ; STK11 ; STK16 ; СТК17А ; СТК17Б ; СТК24 ; СТК25 ; STK26 ; СТК3 ; STK31 ; STK32A ; СТК32Б ; STK32C ; STK33 ; STK35 ; STK36 ; STK38 ; STK38L ; STK39 ; СТК4 ; STK40 ; STKLD1 ; STRADA ; STRADB ; STYK1 ; SYK ; ТАОК1 ; ТАОК2 ; ТАОК3 ; TBCK ; TBK1 ; TEC ; ТЕК ; ТЕСК1 ; ТЕСК2 ; TEX14 ; TGFBR1 ; TGFBR2 ; TIE1 ; TLK1 ; TLK2 ; ТНИК ; ТНК1 ; ТНК2 ; ТННИ3К ; ТП53РК ; TRIB1 ; TRIB2 ; TRIB3 ; ТРИО ; ЦСК1Б ; ЦСК2 ; ЦСК3 ; ЦСК4 ; ЦСК6 ; ТТБК1 ; ТТБК2 ; ТТК ; ТТН ; TXK ; TYK2 ; TYRO3 ; УХМК1 ; ULK1 ; ULK2 ; ULK3 ; ULK4 ; ВРК1 ; ВРК2 ; ВРК3 ; WEE1 ; WEE2 ; WNK1 ; WNK2 ; WNK3 ; WNK4 ; ДА1 ; ZAP70
использованная литература