Фосфоинозитид-зависимая киназа-1 - Phosphoinositide-dependent kinase-1

PDPK1
Доступные конструкции
PDB	Ортолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1H1W , 1OKY , 1OKZ , 1UU3 , 1UU7 , 1UU8 , 1UU9 , 1UVR , 1W1D , 1W1G , 1W1H , 1Z5M , 2BIY , 2PE0 , 2PE1 , 2PE2 , 2R7B , 2VKI , 2XCH , 2XCK , 3H9O , 3HRC , 3HRF , 3ION , 3IOP , 3NAX , 3NAY , 3NUN , 3NUS , 3NUU , 3NUY , 3ORX , 3ORZ , 3OTU , 3PWY , 3QC4 , 3QCQ , 3QCS , 3QCX , 3QCY , 3QD0 , 3QD3 , 3QD4 , 3RCJ , 3RWP , 3RWQ , 3SC1 , 4A06 , 4A07 , 4AW0 , 4AW1 , 4CT1 , 4CT2 , 4RQV , 4RRV , 4XX9 , 5ACK , 5HO7 , 5HO8 , 5HKM , 5HNG
Идентификаторы
Псевдонимы	PDPK1 , PDK1, PDPK2, PRO0461, PDPK2P, фосфоинозитидзависимая киназа-1, 3-фосфоинозитидзависимая протеинкиназа 1
Внешние идентификаторы	OMIM : 605213 MGI : 1338068 HomoloGene : 37643 GeneCards : PDPK1
Расположение гена ( человек )
Chr.	Хромосома 16 (человек)
Конец	2603188 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	24 150 924 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• трансферазной активности ; • связывание нуклеотид ; • активности протеинкиназы ; • фосфолипазы связывания ; • инсулинового рецептора связывания ; • 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы активности ; • белок серин / треонин киназы ; • фосфолипазы активатор активности ; • ГО: связывание 0001948 белок ; • АТФ связывания ; • протеинкиназа связывания ; • киназная активность;
Сотовый компонент	• цитоплазма ; • цитозоль ; • проекция клетки ; • мембрана ; • очаговая адгезия ; • плазматическая мембрана ; • нуклеоплазма ; • соединение клеток ; • ядро ; • перикарион ; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность ; • GO: 0016023 цитоплазматический пузырек;
Биологический процесс	• GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала ; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон ; • внешний апоптотический сигнальный путь ; • негативная регуляция активности протеинкиназы ; • фосфорилирование ; • костимуляция Т-клеток ; • стимулирующий сигнальный путь рецептора лектина С-типа ; • позитивная регуляция высвобождения секвестрированного кальция ион в цитозоль ; • негативная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста ; • гиперосмотический ответ ; • транскрипция, ДНК-шаблон ; • активация тромбоцитов ; • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста ; • сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон ; • позитивная регуляция активности фосфолипазы ; • фосфорилирование белка ; • негативная регуляция процесса апоптоза клеток сердечной мышцы ; • сборка очаговой адгезии ; • негативная регуляция сигнального пути толл-подобных рецепторов ; • фосфорилирование пептидил-серина ; • регуляция миграции эндотелиальных клеток ; • клеточный ответ на стимул инсулина ; • аутофосфорилирование белка ; • регуляция тучных клеток дегрануляция клеток ; • фосфорилирование пептидил-треонина ; • развитие клеток поджелудочной железы типа B ; • сигнальный путь рецепторов Т-клеток ; • миграция клеток ; • организация актинового цитоскелета ; • регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB ; • опосредованная кальцием передача сигналов ; • негативная регуляция апоптотического процесса нейронов ; • клеточный ответ на стимул нейротрофического фактора головного мозга ; • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста ; • позитивная регуляция локализации белка на плазматической мембране ; • активация активности протеинкиназы B ; • позитивная регуляция миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов ; • позитивная регуляция ангиогенеза ; • позитивная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток сосудов ; • позитивная регуляция прорастающего ангиогенеза ; • негативная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	5170
	18607
	ENSG00000140992
	ENSMUSG00000024122
	O15530
	Q9Z2A0
	NM_001261816 ; NM_002613 ; NM_031268
	NM_001080773 ; NM_001286662 ; NM_011062
	NP_001248745 ; NP_002604 ; NP_112558
	NP_001074242 ; NP_001273591 ; NP_035192
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

В области биохимии , PDPK1 относится к белковой 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 , в фермент , который кодируется с помощью PDPK1 гена в организме человека. Он участвует в развитии и прогрессировании меланом .

Функция

PDPK1 мастера - киназа , которая имеет решающее значение для активации AKT / PKB и многого другого AGC киназ , включая PKC , S6K , SGK . PDPK1 играет важную роль в сигнальных путях, активируемых несколькими факторами роста и гормонами, включая передачу сигналов инсулина .

Мыши, лишенные PDPK1, умирают на раннем этапе эмбрионального развития, что указывает на то, что этот фермент важен для передачи сигналов, способствующих росту, необходимых для нормального развития млекопитающих.

Мыши с дефицитом PDPK1 имеют снижение массы тела на ≈40%, легкую непереносимость глюкозы и устойчивы к раку, вызванному гиперактивацией пути PI3K (PTEN +/-).

PDK1 растений играет важную роль в регуляции транспорта ауксина, опосредованного PIN, и, таким образом, участвует в различных процессах развития, таких как эмбриональное развитие, формирование боковых корней, формирование паттерна сосудистой сети, образование апикальных крючков, гравитропизм и фототропизм.

Этимология

PDPK1 обозначает 3- р hosphoinositide- д ependent р rotein K inase 1 . PDPK1 функция вниз по течению PI3K через взаимодействие с PDPK1 мембранными фосфолипидами , включая фосфатидилинозитолы , фосфатидилинозитолы (3,4) -bisphosphate и фосфатидилинозитолы (3,4,5) -trisphosphate . PI3K косвенно регулирует PDPK1, фосфорилируя фосфатидилинозитолы, которые, в свою очередь, генерируют фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трифосфат . Однако считается, что PDPK1 является конститутивно активной и не всегда требует фосфатидилинозитолов для своей активности.

Фосфатидилинозитолы необходимы только для активации на мембране некоторых субстратов, включая AKT . PDPK1, однако, не требует связывания липидов с мембраной для эффективного фосфорилирования большинства своих субстратов в цитозоле (не на клеточной мембране).

Состав

Структура PDPK1 может быть разделена на два домена; киназный или каталитический домен и домен PH . В доменном ИД функции , главным образом , при взаимодействии с PDPK1 фосфатидилинозитолами (3,4) -bisphosphate и фосфатидилинозитолами (3,4,5) -trisphosphate , который играет важной роль в локализации и активации некоторые из мембраны ассоциированных субстратов PDPK1 в том числе AKT .

Киназный домен имеет три сайта связывания лиганда ; сайт связывания субстрата, сайт связывания АТФ и сайт стыковки (также известный как карман PIF). Некоторые субстраты PDPK1, включая S6K и протеинкиназу C , требуют связывания на этом сайте стыковки. Было показано, что низкомолекулярные аллостерические активаторы PDPK1 избирательно ингибируют активацию субстратов, которые требуют взаимодействия с сайтом стыковки. Эти соединения не связываются с активным сайтом и позволяют PDPK1 активировать другие субстраты, которые не требуют взаимодействия с сайтом стыковки. PDPK1 является конститутивно активным, и в настоящее время нет известных белков-ингибиторов PDPK1.

Полагают, что активация основного эффектора PDPK1, AKT, требует правильной ориентации киназных и PH доменов PDPK1 и AKT на мембране.

Взаимодействия

Было показано, что фосфоинозитид-зависимая киназа-1 взаимодействует с:

дальнейшее чтение

Ванхаэсбрук Б., Алесси Д.Р. (2000). «Соединение PI3K-PDK1: больше, чем просто дорога к PKB» . Biochem. Дж . 346 Pt 3 (3): 561–76. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3460561 . PMC 1220886 . PMID 10698680 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Алесси Д.Р., Джеймс С.Р., Даунс С.П., Холмс А.Б., Гаффни П.Р., Риз С.Б., Коэн П. (1997). «Характеристика 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы, которая фосфорилирует и активирует протеинкиназу Balpha» . Curr. Биол . 7 (4): 261–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (06) 00122-9 . PMID 9094314 . S2CID 2094414 .
Мозер Б.А., Деннис П.Б., Пуллен Н., Пирсон Р.Б., Уильямсон Н.А., Веттенхолл Р.Э., Козма С.К., Томас Г. (1997). «Двойная потребность в недавно идентифицированном сайте фосфорилирования в p70s6k» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 5648–55. DOI : 10,1128 / MCB.17.9.5648 . PMC 232413 . PMID 9271440 .
Алесси Д.Р., Дик М., Касамайор А., Кодвелл Ф. Б., Моррис Н., Норман Д. Г., Гаффни П., Риз С. Б., МакДугалл С. Н., Харбисон Д., Эшворт А., Баунс М. (1997). «3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа-1 (PDK1): структурная и функциональная гомология с киназой DSTPK61 дрозофилы» . Curr. Биол . 7 (10): 776–89. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (06) 00336-8 . PMID 9368760 . S2CID 1167390 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Мейер Р., Алесси Д.Р., Крон П., Анджелкович М., Хеммингс Б.А. (1997). «Митогенная активация, фосфорилирование и ядерная транслокация протеинкиназы Bbeta» . J. Biol. Chem . 272 (48): 30491–7. DOI : 10.1074 / jbc.272.48.30491 . PMID 9374542 .
Алесси Д.Р., Козловски М.Т., Венг К.П., Моррис Н., Авруч Дж. (1998). «3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа 1 (PDK1) фосфорилирует и активирует киназу p70 S6 in vivo и in vitro» (PDF) . Curr. Биол . 8 (2): 69–81. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70037-5 . PMID 9427642 . S2CID 18688785 .
Долби К.Н., Моррис Н., Кодвелл Ф. Б., Аврух Дж., Коэн П. (1998). «Идентификация регуляторных сайтов фосфорилирования в митоген-активированной протеинкиназе (MAPK) -активированной протеинкиназы-1a / p90rsk, которые индуцируются MAPK» . J. Biol. Chem . 273 (3): 1496–505. DOI : 10.1074 / jbc.273.3.1496 . PMID 9430688 .
Пуллен Н., Деннис П.Б., Анджелкович М., Дюфнер А., Козма С.К., Хеммингс Б.А., Томас Г. (1998). «Фосфорилирование и активация p70s6k PDK1». Наука . 279 (5351): 707–10. DOI : 10.1126 / science.279.5351.707 . PMID 9445476 .
Стивенс Л., Андерсон К., Стокоу Д., Эрдджумент-Бромаж Х, Пейнтер Г.Ф., Холмс А.Б., Гаффни П.Р., Риз С.Б., Маккормик Ф., Темпст П., Коадвелл Дж., Хокинс П.Т. (1998). «Киназы протеинкиназы B, которые опосредуют фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфат-зависимую активацию протеинкиназы B». Наука . 279 (5351): 710–4. DOI : 10.1126 / science.279.5351.710 . PMID 9445477 .
Уокер К.С., Деак М., Патерсон А., Хадсон К., Коэн П., Алесси Д.Р. (1998). «Активация изоформ протеинкиназы B бета и гамма инсулином in vivo и 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназой-1 in vitro: сравнение с протеинкиназой B альфа» . Biochem. Дж . 331 (Pt 1) (1): 299–308. DOI : 10.1042 / bj3310299 . PMC 1219352 . PMID 9512493 .
Андерсон К. Э., Коадвелл Дж, Стивенс Л. Р., Хокинс П. Т. (1998). «Транслокация PDK-1 к плазматической мембране важна для того, чтобы позволить PDK-1 активировать протеинкиназу B» . Curr. Биол . 8 (12): 684–91. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70274-X . PMID 9637919 . S2CID 13936854 .
Le Good JA, Ziegler WH, Parekh DB, Alessi DR, Cohen P, Parker PJ (1998). «Изотипы протеинкиназы C, контролируемые фосфоинозитид-3-киназой через протеинкиназу PDK1». Наука . 281 (5385): 2042–5. DOI : 10.1126 / science.281.5385.2042 . PMID 9748166 .
Карри Р.А., Уокер К.С., Грей А., Дик М., Касамайор А., Даунс С.П., Коэн П., Алесси Д.Р., Люкок Дж. (1999). «Роль фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфата в регулировании активности и локализации 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1» . Biochem. Дж . 337 (Pt 3) (3): 575–83. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3370575 . PMC 1220012 . PMID 9895304 .
Кобаяши Т., Коэн П. (1999). «Активация регулируемой сывороткой и глюкокортикоидами протеинкиназы агонистами, активирующими фосфатидилинозитид-3-киназу, опосредуется 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназой-1 (PDK1) и PDK2» . Biochem. Дж . 339 (Pt 2) (2): 319–28. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3390319 . PMC 1220160 . PMID 10191262 .
Балендран А., Касамайор А., Дик М., Патерсон А., Гаффни П., Карри Р., Даунс С. П., Алесси Д. Р. (1999). «PDK1 приобретает активность PDK2 в присутствии синтетического пептида, происходящего от карбоксильного конца PRK2» . Curr. Биол . 9 (8): 393–404. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (99) 80186-9 . PMID 10226025 . S2CID 16473977 .
Парк Дж., Леонг М.Л., Бузе П., Майяр А.С., Файерстоун Г.Л., Хеммингс Б.А. (1999). «Сыворотка и глюкокортикоид-индуцируемая киназа (SGK) является мишенью для сигнального пути, стимулированного PI 3-киназой» . EMBO J . 18 (11): 3024–33. DOI : 10.1093 / emboj / 18.11.3024 . PMC 1171384 . PMID 10357815 .
Paradis S, Ailion M, Toker A, Thomas JH, Ruvkun G (1999). «Гомолог PDK1 необходим и достаточен для трансдукции сигналов киназы AGE-1 PI3, которые регулируют диапаузу у Caenorhabditis elegans» . Genes Dev . 13 (11): 1438–52. DOI : 10.1101 / gad.13.11.1438 . PMC 316759 . PMID 10364160 .
Касамайор А., Моррис Н. А., Алесси Д. Р. (1999). «Фосфорилирование Ser-241 необходимо для активности 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1: идентификация пяти сайтов фосфорилирования in vivo» . Biochem. Дж . 342 (Pt 2) (2): 287–92. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3420287 . PMC 1220463 . PMID 10455013 .

Внешние ссылки

3-фосфоинозитид-зависимый + протеин + киназа в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)

Languages

In other projects