Вироид веретеновидных клубней картофеля - Potato spindle tuber viroid

Вироид веретеновидных клубней картофеля
Классификация вирусов е
(без рейтинга): Вирус
Царство : incertae sedis
Королевство: incertae sedis
Тип: incertae sedis
Класс: incertae sedis
Заказ: incertae sedis
Семья: Pospiviroidae
Род: Поспивироид
Разновидность:
Вироид веретеновидных клубней картофеля

Картофельный клубень шпиндель вироидный ( PSTVd ) была первым вироидным быть идентифицирован. PSTVd ​​- это небольшая одноцепочечная кольцевая молекула РНК , тесно связанная с вироидом хризантемы stunt . Внутри вироидальной РНК присутствует петля ствола мотива Pospiviroid RY, общая для этого рода. Естественными хозяевами являются картофель ( Solanum tuberosum ) и томаты ( Solanum lycopersicum ). Весь картофель и томаты восприимчивы к PSTVd, и естественной резистентности не существует. Естественные инфекции также наблюдались у авокадо, а инфекции у других пасленовых культур вызывались в лаборатории. До 2017 года считалось, что PSTVd ​​не может инфицировать Solanum sisymbriifolium . Затем в мае было обнаружено заражение семян, экспортируемых голландской компанией. Эти семена были отправлены от компании, но изначально были выведены в соответствии с их спецификациями в двух азиатских странах.

Штаммы и их симптомы

Существуют различные штаммы PSTVd, и симптомы варьируются от легких до тяжелых. Легкие штаммы не вызывают явных симптомов. Симптомы при тяжелых формах штамма зависят от условий окружающей среды и наиболее серьезны в жарких условиях. Симптомы могут быть легкими при начальных инфекциях, но постепенно ухудшаются в следующих поколениях. Общие симптомы тяжелых инфекций включают изменение цвета листвы, более мелкие листья и веретенообразное удлинение. Прорастание также происходит медленнее, чем у непораженного картофеля. Зараженные помидоры медленнее проявляют симптомы, в том числе задержку роста с «пучком наверху», вызванную укорочением межузловых узлов. Листья становятся желтыми или пурпурными, часто скручиваются и скручиваются. В конечном итоге происходит некроз жилок нижних и средних листьев, а верхние листья уменьшаются в размерах. Также нарушается созревание плодов, что приводит к появлению твердых, мелких темно-зеленых помидоров.

Распространение PSTVd ​​на большие расстояния обычно происходит через инфицированные семена, но передача через тлю ( Myzus persicae ) также происходит, но только в присутствии PLRV ( вирус скручивания листьев картофеля ). Механическая передача также происходит после того, как она попала в зону.

Первичная и вторичная структура PSTVd

PSTVd ​​состоит из 359 нуклеотидов .

Первичная структура 
  1   CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAA
 61   GAAGGCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGGGAA ACCUGGAGCG AACUGGCAAA
121   AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU
181   CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU
241   GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUUU
301   CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU
Вторичная структура
Предполагаемая вторичная структура вироида PSTVd. Выделенные нуклеотиды встречаются в большинстве других вироидов.

Течение инфекции

Системное движение внутри инфицированного хозяина происходит через флоэму .

Рекомендации

Библиография