Галобактерии - Halobacteriales
Галобактерии | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Порядок: |
Галобактерии
Грант и Ларсен, 1989
|
Семья | |
В таксономии , в Halobacteriales является порядком из галобактерии , найденный в воде , насыщенный или почти насыщенная солью. Их также называют галофилами , хотя это название также используется для других организмов, которые живут в несколько менее концентрированной соленой воде. Они распространены в большинстве сред, где доступно большое количество соли, влаги и органических материалов. Крупные соцветия кажутся красноватыми из-за пигмента бактериородопсина . Этот пигмент используется для поглощения света, который обеспечивает энергию для создания АТФ . Галобактерии также обладают вторым пигментом, галородопсином , который накачивает ионы хлора в ответ на фотоны, создавая градиент напряжения и способствуя выработке энергии из света. Этот процесс не связан с другими формами фотосинтеза с участием транспорта электронов; однако галобактерии не способны связывать углерод из углекислого газа .
Галобактерии могут существовать в соленой среде, потому что, хотя они являются аэробами, у них есть отдельный и другой способ создания энергии посредством фотосинтеза . Части мембран галобактерий пурпурного цвета. Эти части проводят фотосинтетические реакции с пигментом сетчатки, а не с хлорофиллом . Это позволяет им создавать протонный градиент через мембрану клетки, который можно использовать для создания АТФ для собственного использования. Некоторые виды в этом порядке используются в качестве модельных организмов для изучения того, как некоторые микроорганизмы могут выживать в гиперсоленой среде, понимания клеточных процессов и исследования их физиологии.
Экология
Среды обитания
Обычно галобактерии растут в аэробной среде и среде с высокой соленостью. Галобактерии были обнаружены в соленых озерах, морских солончаках, морской воде, солнечных солях и соленых пищевых продуктах. Чаще всего представители отряда Halobacteriales могут находиться в средах, где концентрация соли (NaCl) превышает 25%. Однако они также могут выжить в средах с низкой концентрацией соли, от 1 до 3,5%. Исследования показывают, что галобактерии также можно найти в средах, в которых происходит снижение содержания серы, а также в соленых солончаках, черных курильщиках с морской водой, прибрежных солончаках и трубопроводах. Эти результаты показывают, что галобактериям требуется только количество соли, достаточное для предотвращения их лизиса, и поэтому они могут расти в средах с низкой концентрацией соли.
Текущая таксономия
Галобактерии - это большая филогенетически разнообразная линия, охватывающая все виды галобактерий. Большое разнообразие биохимических характеристик и различные экологические ниши класса Haloarchaea оказались ненадежным инструментом в выяснении эволюционных взаимоотношений Halobacteria выше уровня рода.
В 2015 году Гупта и др. предложили разделение класса Haloarchaea на три порядка, Halobacteriales, Haloferacales и Natrialbales на основе сравнительного геномного анализа и паттерна ветвления различных филогенетических деревьев, построенных из нескольких различных наборов данных консервативных белков и последовательностей 16S рРНК. Это подразделение сильно ограничило членство в отряде Halobacteriales, включив в него только виды, которые были тесно связаны с типовым родом Halobacterium.
Последующее исследование, посвященное изучению более высоких таксономических отношений внутри отряда Halobacteriales, привело к разделению отряда на три семейства: Halobacteriaceae , Haloarculaceae и Halococcaceae , каждое из которых можно отличить друг от друга и от всех других видов по наличию множества высокоспецифичных молекулярных сигнатур. , известные как индели с сохраненной подписью .
использованная литература
дальнейшее чтение
Журналы
- Wright AG (июнь 2006 г.). «Филогенетические отношения внутри порядка Halobacteriales, выведенные из последовательностей гена 16S рРНК» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (Pt 6): 1223–1227. DOI : 10.1099 / ijs.0.63776-0 . PMID 16738095 .
- Судебная комиссия Международного комитета по систематике прокариот (январь 2005 г.). «В номенклатурные типы заказов Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales и Verrucomicrobiales являются роды Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus , Thermococcus, Thermoproteus и Verrucomicrobium, соответственно. Мнение 79 " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 55 (Pt 1): 517–518. DOI : 10.1099 / ijs.0.63548-0 . PMID 15653928 .
- Кавальер-Смит Т. (январь 2002 г.). «Неомуранское происхождение архебактерий, негибактериальный корень универсального дерева и бактериальная мегаклассификация» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Pt 1): 7–76. DOI : 10.1099 / 00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Euzéby JP, Tindall BJ (март 2001 г.). «Номенклатурный тип заказов: исправления, необходимые в соответствии с Правилами 15 и 21а Бактериологического кодекса (редакция 1990 г.), и обозначение соответствующих номенклатурных типов классов и подклассов. Запрос заключения» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Pt 2): 725–727. DOI : 10.1099 / 00207713-51-2-725 . PMID 11321122 .
- Кавальер-Смит Т. (1986). «Царства организмов». Природа . 324 (6096): 416–7. Bibcode : 1986Natur.324..416C . DOI : 10.1038 / 324416a0 . PMID 2431320 . S2CID 5242667 .
- Гупта Р.С., Наушад С., Бейкер С. (март 2015 г.). «Филогеномный анализ и молекулярные сигнатуры для класса Halobacteria и двух его основных кладов: предложение о разделении класса Halobacteria на измененный порядок Halobacteriales и два новых отряда, Haloferacales ord. Nov. И Natrialbales ord. Nov., Содержащие новые семейства. Haloferacaceae fam. Nov. И Natrialbaceae fam. Nov " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (Pt 3): 1050–1069. DOI : 10.1099 / ijs.0.070136-0 . PMID 25428416 .
Книги
- Грант В.Д., Камекура М., МакГенити Т.Дж., Вентоза А. (2001). «Класс III. Класс галобактерий. Nov.» . В DR Boone, RW Castenholz (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.
- Грант В. Д., Ларсен Х (1989). «Группа III. Чрезвычайно галофильные археобактерии. Отряд Halobacteriales ord. Nov.». В JT Staley, MP Bryant, N Pfennig, JG Holt (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, Том 3 (1-е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins Co., стр. 169.
Базы данных
- Ссылки PubMed по галобактериям
- Ссылки PubMed Central по галобактериям
- Ссылки Google Scholar по Halobacteriales