Эвриархеота - Euryarchaeota
| Euryarchaeota | |
|---|---|
|
|
| Halobacterium sp. штамм NRC-1, каждая клетка около 5 мкм в длину. | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Королевство: |
Euryarchaeota
|
| Phyla | |
|
|
| Синонимы | |
|
|
Эвриархеоты (греческий язык для «широкого старого качества») является фила из архей . Это один из двух типов архей, другой - кренархей . Эвриархеи очень разнообразны и включают метаногены , которые производят метан и часто встречаются в кишечнике, галобактерии , которые выживают при экстремальных концентрациях соли , а также некоторые чрезвычайно термофильные аэробы и анаэробы, которые обычно живут при температуре от 41 до 122 ° C. Они отделены от других архей в основном на основе последовательностей рРНК и их уникальной ДНК-полимеразы.
Описание
Эвриархеоты разнообразны по внешнему виду и метаболическими свойствами. Тип содержит организмы самых разных форм, включая палочки и кокки . Euryarchaeota может быть грамположительной или грамотрицательной в зависимости от того, присутствует ли псевдомуреин в клеточной стенке. Euryarchaeota также демонстрируют разнообразный образ жизни, включая метаногены, галофилы, сульфатредукторы и экстремальные термофилы в каждом из них. Другие живут в океане, взвешенные планктоном и бактериями. Хотя эти морские эвриархеи сложно культивировать и изучать в лаборатории, геномное секвенирование позволяет предположить, что они подвижные гетеротрофы .
Хотя ранее считалось, что эвриархеи обитают только в экстремальных условиях (с точки зрения температуры, содержания соли и / или pH), статья Корженкова и др., Опубликованная в январе 2019 года, показала, что эвриархеи также живут в умеренных средах, таких как низкотемпературные. кислая среда. В некоторых случаях эвриархеи превосходили присутствующие бактерии. Эвриархеи также были обнаружены в других умеренных средах, таких как водные источники, болота, почва и ризосферы . Некоторые эвриархеи легко адаптируются; Отряд, называемый Halobacteriales, обычно встречается в чрезвычайно соленой и богатой серой окружающей среде, но может также расти при концентрациях соли до 2,5% в морской воде. В ризосферах присутствие эвриархей, по-видимому, зависит от присутствия микоризных грибов ; более высокая популяция грибов коррелировала с более высокой частотой и разнообразием эвриархеот, в то время как отсутствие микоризных грибов коррелировало с отсутствием эвриархеот.
Филогения
| филогения основана на высвобождении LTP на основе 16S рРНК 121 | Dombrowski et al. 2019, Джордан и др. 2017 и Cavalier-Smith2020. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), а филогения основана на выпуске 121 LTP на основе 16S рРНК, разработанном «All-Species Living Tree». Проект .
|
Другой филогенетический анализ показал, что археи клады DPANN также могут принадлежать к Euryarchaeota и что они могут даже быть полифилетической группой, занимающей разные филогенетические позиции внутри Euryarchaeota. Также обсуждается, следует ли классифицировать тип Altiarchaeota в DPANN или Euryarchaeota. Кладограмма, обобщающая это предложение, представлена на графике ниже. Группы, отмеченные кавычками, представляют собой линии, присвоенные DPANN, но филогенетически отделенные от остальных.
|
Третья филогения от Annotree и GTDB в выпуске 05-RS95 (17 июля 2020 г.).
|
Euryarchaeota ss
|
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение
- Кавалер-Смит Т. (январь 2002 г.). «Неомуранское происхождение архебактерий, негибактериальный корень универсального дерева и бактериальная мегаклассификация» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Pt 1): 7–76. DOI : 10.1099 / 00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Woese CR, Gupta R, Hahn CM, Zillig W, Tu J (1984). «Филогенетические отношения трех серозависимых архебактерий». Систематическая и прикладная микробиология . 5 : 97–105. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (84) 80054-5 . PMID 11541975 .
- Гаррити GM, Холт JG (2001). "Тип AII. Euryarchaeota phy. Nov." . В DR Boone, RW Castenholz (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . С. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.