Фонд открытой биоинформатики - Open Bioinformatics Foundation
Биоинформатика Foundation Open является некоммерческой , волонтерской работать организация , ориентированная на поддержку программ с открытым исходным кодом в биоинформатике . Миссия фонда - поддерживать разработку наборов инструментов с открытым исходным кодом для биоинформатики, организовывать ориентированные на разработчиков хакатоны и в целом оказывать помощь в разработке и продвижении разработки программного обеспечения с открытым исходным кодом в области наук о жизни. Фонд также организует и проводит ежегодную конференцию по биоинформатике с открытым исходным кодом , сопутствующую встречу конференции « Интеллектуальные системы для молекулярной биологии» . Фонд участвует в Google Summer of Code , выступая в качестве зонтичной организации для отдельных проектов, связанных с биоинформатикой.
Фонд Open Bioinformatics Foundation был основан в 2001 году в результате проектов BioJava , BioPerl и BioPython . Официальное членство в фонде было создано в 2005 году. В октябре 2012 года фонд начал ассоциацию с Software in the Public Interest (SPI), американской некоммерческой организацией, которая помогает другим организациям в создании и распространении бесплатных и открытых - исходное программное обеспечение . Связь с SPI позволяет делать финансовые пожертвования в фонд (в США они не облагаются налогом по статье 501 (c) 3).
Фондом управляет совет директоров, представляющий различные проекты Bio *. С 2019 года президентом OBF является Питер Кок ( BioPython ). Предыдущими президентами OBF были Эван Бирни и Хилмар Лапп ( NESCent ), в предыдущие члены Совета входил Стивен Э. Бреннер .
Проекты
Фонд размещает серверы для списков рассылки, веб-сайтов и репозиториев кода для ряда проектов с открытым исходным кодом, связанных с биоинформатикой, включая:
- BioJava - набор инструментов Java
- BioMOBY - выполнение данных и приложений через веб-службы
- BioPerl - набор инструментов Perl
- BioPython - набор инструментов Python
- BioRuby - инструментарий Ruby
- BioPHP
- EMBOSS - набор инструментов для анализа последовательности.
Смотрите также
- Список программного обеспечения для биоинформатики с открытым исходным кодом
- База данных универсальных модельных организмов