Caldalkalibacillus -Caldalkalibacillus
Caldalkalibacillus | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Учебный класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: |
Caldalkalibacillus
Xue et al. 2006 г.
|
Разновидность | |
Синонимы | |
Thermalkalibacillus |
Caldalkalibacillus - это аэробный и спорообразующий род бактерий из семейства Bacillaceae, окрашивающий либо грамположительные, либо грамположительные. Типовой вид этого рода - Caldalkalibacillus thermarum.
Caldalkalibacillus mannanilyticus ранее был видом, принадлежащим к Bacillus , роду, который был признан проявляющим обширную полифилию и был ограничен недавними филогенетическими исследованиями, чтобы включать только виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus .
Название Caldalkalibacillus образовано от приставки «-caldalkali» (от латинского прилагательного caldus , которое переводится как «горячий» и латинского существительного щелкали ), и суффикса «-bacillus» (от латинского существительного bacillus , относящегося к небольшому стержень). Вместе Caldalkalibacillus превращается в бациллу, живущую в горячих и щелочных условиях).
Биохимические характеристики и молекулярные сигнатуры
Члены этого рода аэробны, а некоторые подвижны и образуют эндоспоры. Образующиеся колонии желтого или желтовато-белого цвета. Диапазон температур для роста составляет 20–65 ° C, с оптимальной температурой роста для C. mannanilyticus около 37 ° C, тогда как C. thermarum оптимально растет при 60 ° C. Диапазон pH для роста составляет 7,5–10, с оптимальным ростом при pH 8,5–9,0.
Четыре сохраняющиеся подписи инсерций (ИКА) были идентифицированы с помощью геномных анализов для этого рода в следующих белках: префената дегидрогеназы , изопрениловые трансферазы, DUF1027 домен , содержащий белок и аденин деаминазы , которые в большинстве случаев исключительно разделяют все или большинство членов этой род. Эти CSI обеспечивают надежные молекулярные средства отличия видов Caldalkalibacillus от других родов Bacillaceae и бактерий.
Таксономия
Caldalkalibacillus , по состоянию на май 2021 года, содержит в общей сложности 3 вида с правильно опубликованными названиями. Этот паттерн ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома (GTDB).
использованная литература
дальнейшее чтение
- Чжао, Вт; Чжан, CL; Романек, CS; Вигель, Дж (май 2008 г.). «Описание Caldalkalibacillus uzonensis sp. Nov. И исправленное описание рода Caldalkalibacillus» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (Pt 5): 1106–8. DOI : 10.1099 / ijs.0.65363-0 . PMID 18450697 .
- Kalamorz, F .; Keis, S .; Макмиллан, DGG; Olsson, K .; Stanton, J.-A .; Stockwell, P .; Черный, Массачусетс; Klingeman, DM; Земля, ML; Хан, CS; Мартин, SL; Becher, SA; Педди, CJ; Морган, HW; Matthies, D .; Preiss, L .; Meier, T .; Браун, SD; Кук, GM (17 июня 2011 г.). «Проект последовательности генома термоалкалифильного штамма Caldalkalibacillus thermarum TA2.A1» . Журнал бактериологии . 193 (16): 4290–4291. DOI : 10.1128 / JB.05035-11 . PMC 3147688 . PMID 21685297 .
- Бертран, Жан-Клод; Caumette, Пьер; Лебарон, Филипп; Матерон, Роберт; Норманд, Филипп; Симе-Нгандо, Телесфор (2015). Экологическая микробиология: основы и приложения: микробная экология . Springer. ISBN 9789401791182.