Бациллы - Bacilli

Бациллы
Bacillus subtilis Gram.jpg
Bacillus subtilis , окраска по Граму
Научная классификация е
Домен: Бактерии
Тип: Фирмикуты
Класс: Bacilli
Ludwig et al. 2010 г.
Заказы

Бациллы являются таксономическим классом из бактерий , которые включают в себя два порядка, Bacillales и Lactobacillales , которые содержат несколько хорошо известные патогенные микроорганизмы , такие как Bacillus сибирской язвы (причину сибирской язвы ). Бациллы - это почти исключительно грамположительные бактерии .

Название Bacillus , написанное с большой буквы и курсивом , относится к определенному роду бактерий. Название Bacilli, написанное с большой буквы, но без курсива, может также относиться к менее специфической таксономической группе бактерий, которая включает два отряда, один из которых содержит род Bacillus . Когда слово написано строчными буквами, а не курсивом, «бацилла», скорее всего, оно будет относиться к форме, а не к роду вообще.

Двусмысленность

В нескольких связанных концепциях используются похожие слова, и неоднозначность может создать значительную путаницу. Термин « Bacillus » (с большой буквы и курсивом) также является названием рода ( Bacillus anthracis ), который, среди многих других родов, относится к классу Bacilli.

Слово « бацилла » (или его множественное число «бациллы» с маленькой буквой b) также является общим термином для описания морфологии любой палочковидной бактерии. Этот общий термин не означает, что субъект является членом класса Bacilli или рода Bacillus . Таким образом, это не обязательно подразумевает аналогичную группу характеристик. Не все представители класса Bacilli имеют палочковидную форму ( стафилококки имеют сферическую форму), и существует множество других палочковидных бактерий, не подпадающих под этот класс (например, Clostridium имеет палочковидную форму, но очень отличается таксономически). Более того, общий термин «палочка» не обязательно указывает на грамположительное окрашивание, обычное для класса Bacilli. Например, E. coli представляет собой палочковидную бактерию, которую можно описать как «палочку», но она окрашивает грамотрицательные бактерии и не принадлежит к роду Bacillus или классу Bacilli. Некоторые микробиологи отказались от общего термина «бацилла» из-за путаницы, которую она может создать.

Филогения

Филогения основана на выпуске 132 LTP на основе 16S рРНК, разработанном The All-Species Living Tree Project , с принятой в настоящее время таксономией, основанной на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN), Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) и некоторые непроверенные названия клад из базы данных таксономии генома .

Бациллы

Calditerricola {"Calditerricolales" ♥: "Calditerricolaceae" ♥}

Кирпидия {"Kyrpidiales" ♥: "Kyrpidiaceae" ♥}

Thermoactinomycetaceae {"Thermoactinomycetales" ♥}

Caldalkalibacillus {"Caldalkalibacillales" ♥: "Caldalkalibacillaceae" ♥}

Thermicanales  ♥

" Thermicanaceae " ♥

« Новибацилловые » ♥

« Тумебациллы » ♥

" Effusibacillaceae " ♥

« Тумебациллы » ♥

« Алициклобациллы » ♥

« Acidibacillaceae » ♥

Alicyclobacillaceae

" Paenibacillales " ♥

Ammoniibacillus

Paenibacillaceae

Микроаэробактер

" Tepidibacillaceae " ♥ {"Tepidibacillales" ♥}

Мелгирибацилла

Группа видов Bacillus 2

« Salisediminibacteriaceae » ♥

" Marinococcaceae " ♥

Bacillaceae 2

" Amphibacillaceae " ♥

Aureibacillus

« Fictibacillaceae » ♥

Споролактобациллы

« Анаэробациллы » ♥

(продолжение)

Бациллы часть 2 (продолжение)

Бациллы часть 2

Bacillaceae (включая Planococcaceae ) { Bacillales }

" Domibacillaceae " ♥

« Аноксибациллярные » ♥

Bacillus koreensis

Листериевые

Desulfuribacillus

Exiguobacterium {"Exiguobacterales" ♥: "Exiguobacteraceae" ♥}

Paenibacillaceae 2

Aneurinibacillus {"Aneurinibacillales" ♥: "Aneurinibacillaceae" ♥}

Brevibacillus {"Brevibacillales" ♥: "Brevibacillaceae" ♥}

Стафилококковые

Gemella

Афрагмобактерии

Галоплазма сократительная

Turicibacter sanguinis

Астеролеплазма

Eggerthiaceae { Eggerthiales }

Erysipelotrichaceae { Erysipelotrichales }

Молликуты

Анаэроплазма { Anaeroplasmataceae }

Acholeplasma { Acholeplasmatales : Acholeplasmataceae }

Mycoplasmatales

Mycoplasmataceae (включая Entomoplasmataceae ; Spiroplasmataceae )

Ureaplasmataceae

Лактобациллы

Aerococcaceae

Грануликателла

Атопобактер

Карнобактерии 2

Carnobacteriaceae + Enterococcaceae + Streptococcaceae

Lactobacillus виды-группа 2

Lactobacillus floricola

Leuconostocaceae

Лактобациллы

Неклассифицированные бациллы

  • "Candidatus Izimaplasma " ♠ {"Izimaplasmatales" ♥: "Izimaplasmataceae" ♥}
  • "Candidatus Lumbricoplasma " ♠ {Lumbricoplasmataceae ♠}
  • "Rubeoparvulaceae" ♥ {"Rubeoparvulales" ♥}

Примечания:
♥ Имена кладов не зарегистрированы в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) или перечислены в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN).

использованная литература

  1. ^ Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл-Хайнц; Уитмен, Уильям Б. (2015). «Бациллы класс. Ноябрь». Руководство Берджи по систематике архей и бактерий . п. 1. дои : 10.1002 / 9781118960608.cbm00033 . ISBN 9781118960608.
  2. ^ "16S рРНК на основе LTP, выпуск 132 (полное дерево)" . Проект «Живое дерево всех видов» . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 20 июля 2018 .
  3. ^ JP Euzéby. «Бациллы» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) . Проверено 20 июля 2018 .
  4. ^ Сэйерс; и другие. «Бациллы» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2018 .
  5. ^ "Таксономия GTDB" . База данных таксономии генома . Архивировано из оригинала на 2018-07-29 . Проверено 20 июля 2018 .