F-АТФаза - F-ATPase
| F-АТФаза | |
|---|---|
 Упрощенная модель F O F 1 -АТФазы, называемой АТФ-синтазой E. coli . Субъединицы фермента помечены соответствующим образом.
| |
| Идентификаторы | |
| Символ | F-АТФаза |
| TCDB | 3.A.2 |
| OPM суперсемейство | 5 |
| Белок OPM | 6fkf |
| Мембранома | 227 |
F-АТФаза , также известная как АТФаза F-типа , представляет собой АТФазу / синтазу, обнаруженную в бактериальных плазматических мембранах , во внутренних мембранах митохондрий (при окислительном фосфорилировании , где оно известно как Комплекс V) и в мембранах тилакоидов хлоропластов . Он использует протонный градиент для управления синтезом АТФ, позволяя пассивному потоку протонов через мембрану опускаться до их электрохимического градиента и используя энергию, выделяемую транспортной реакцией, для высвобождения вновь образованного АТФ из активного центра F-АТФазы. Вместе с V-ATPases и A-ATPases, F-ATPases принадлежат к суперсемейству родственных вращающихся ATPases .
F-АТФаза состоит из двух доменов:
- домен F o , который встроен в мембрану и состоит из 3 различных типов интегральных белков, классифицируемых как a, b и c.
- F 1 , который является периферическим (со стороны мембраны, в которую движутся протоны). F 1 состоит из 5 полипептидных единиц α3β3γδε, которые связываются с поверхностью домена F o .
F-АТФазы обычно работают как АТФ-синтазы вместо АТФаз в клеточной среде. Другими словами, он обычно производит АТФ из протонного градиента вместо того, чтобы работать в другом направлении, как это обычно делают V-АТФазы. Иногда они превращаются в АТФазы у бактерий.
Состав
Частицы F o -F 1 в основном состоят из полипептидов . F 1 -частица содержит 5 типов полипептидов с соотношением составов 3α: 3β: 1δ: 1γ: 1ε. F o имеет состав 1a: 2b: 12c. Вместе они образуют роторный двигатель. Когда протоны связываются с субъединицами домена F o , они заставляют его части вращаться. Это вращение передается «распределительным валом» в область F 1 . АДФ и Pi (неорганический фосфат) спонтанно связываются с тремя субъединицами β домена F 1 , так что каждый раз, когда он проходит через поворот на 120 °, высвобождается АТФ (вращательный катализ).
Домены F o расположены внутри мембраны, охватывая бислой фосфолипидов, в то время как домен F 1 простирается в цитозоль клетки, облегчая использование вновь синтезированного АТФ.
Митохондриальная F 1 -АТФаза крупного рогатого скота в комплексе с белком-ингибитором If1 часто цитируется в соответствующей литературе. Примеры его использования можно найти во многих клеточных фундаментальных метаболических процессах, таких как ацидоз и алкалоз и газообмен в дыхательных путях.
Буква o в F o обозначает олигомицин , потому что олигомицин способен подавлять его функцию.
N-АТФаза
N-АТФазы - это группа АТФаз F-типа без субъединицы дельта / OSCP , обнаруживаемая у бактерий и группы архей посредством горизонтального переноса генов. Они переносят ионы натрия вместо протонов и имеют тенденцию гидролизовать АТФ. Они образуют отдельную группу, которая дальше от обычных F-АТФаз, чем А-АТФазы от V-АТФаз.