Erwiniaceae - Erwiniaceae
| Erwiniaceae | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Класс: | |
| Порядок: | |
| Семья: |
Erwiniaceae
Адеолу и др., 2016
|
| Роды | |
Erwiniaceae представляют собой семейство из грам-отрицательных бактерий , который включает в себя ряд патогенов растений и насекомых эндосимбионтов. Это семейство является членом отряда Enterobacterales класса Gammaproteobacteria типа Proteobacteria . Типовой род этого семейства - Erwinia .
Название Erwiniaceae происходит от латинского термина Erwinia , обозначающего типовой род семейства, и суффикса «-aceae», окончания, используемого для обозначения семейства. Вместе Erwiniaceae относится к семейству, номенклатурным типом которого является род Erwinia .
Биохимические характеристики и молекулярные сигнатуры
Эти бактерии являются каталаза-положительными, оксидазо-отрицательными и не продуцируют индол или сероводород. Большинство видов являются положительными на тест Фогеса -Проскауэра , за исключением Erwinia toletana, Erwinia ypographi и некоторых штаммов Erwinia oleae.
12 консервативных сигнатурных инделей (CSI) были идентифицированы посредством геномного анализа как эксклюзивные для этого семейства в белках глутамат-цистеинлигаза , ДНК-гираза (субъединица B), сборочный белок LPS LptD, тиол: дисульфидный обменный белок, предшественник DsbA, двухкомпонентный сенсорный гистидин. киназа, РНК-геликаза , тРНК псевдоуридин (13) синтаза TruD, глицин / бетаин-транспортер ABC, АТФ-связывающий белок, супероксиддисмутаза и индуцируемый в стационарной фазе белок CsiE. Эти CSI обеспечивают надежный молекулярный метод идентификации и дифференциации видов Erwiniaceae от других семейств в отряде Enterobacterales и других бактерий.
Историческая систематика и современная таксономия
Erwiniaceae , по состоянию на 2021 год, содержит восемь официально опубликованных родов. Члены этого семейства изначально были членами семейства Enterobacteriaceae , большой филогенетически неродственной группы видов с различными биохимическими характеристиками и различными экологическими нишами. Первоначальное отнесение видов к семейству Enterobacteriaceae было в значительной степени основано на анализе последовательности генома 16S рРНК, который, как известно, имеет низкую дискриминационную способность, а результаты изменений зависят от используемого алгоритма и информации об организме. Несмотря на это, анализы по-прежнему демонстрируют полифилетическое ветвление, что указывает на наличие отдельных подгрупп внутри семейства.
В 2016 году Адеолу и др. предложили разделение Enterobacteriaceae на 7 новых семейств на основе сравнительного геномного анализа и схемы ветвления различных филогенетических деревьев, построенных на основе консервативных последовательностей генома, последовательностей 16S рРНК и анализа мультилокусных последовательностей. Молекулярные маркеры, особенно консервативные индели сигнатур , специфичные для этого семейства, также были идентифицированы как свидетельство, подтверждающее разделение, независимое от филогенетических деревьев.
использованная литература
 
|
Эта статья о Gammaproteobacteria незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |