NRXN1 - NRXN1

NRXN1
Доступные конструкции
PDB	Ортолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3B3Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NRXN1 , Hs.22998, PTHSL2, SCZD17, нейрексин 1
Внешние идентификаторы	OMIM : 600565 MGI : 1096391 HomoloGene : 21005 GeneCards : нейрексин-1
Расположение гена ( человек )
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	51,225,575 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	91 093 071 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• ион металла связывания ; • кальций-зависимого связывания с белками ; • нейролигины белок семейства связывания ; • сигнализации связывания рецептора ; • трансмембранный сигнализации активности рецептора ; • молекулы клеточной адгезии связывания ; • GO: связывание 0001948 белок ; • 1 типа фибробластов связывающий рецептор фактора роста ; • ион кальция связывания ; • рецептора ацетилхолина связывание ; • активность регулятора кальциевых каналов ; • активность сигнального рецептора;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны ; • везикулы ; • ядерная мембрана ; • мембрана ; • эндоцитотический везикулы ; • рост аксонов конуса ; • синапса ; • клеточной поверхности ; • межклеточные контакты ; • нейрональные клетки тела ; • эндоплазматический ретикулум ; • пресинаптической мембраны ; • плазматической мембраны ; • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны ; • presynapse ; • интеграл компонент плазматической мембраны ; • ядрышко ; • белковосодержащий комплекс ; • коллатераль Шаффера - синапс CA1 ; • глутаматергический синапс ; • ГАМК-ергический синапс ; • неотъемлемый компонент мембраны пресинаптической активной зоны;
Биологический процесс	• кальций-зависимой клеточной адгезии-клеток с помощью плазматической мембраны клетки адгезии молекул ; • рецепторов локализации в синапс ; • гетерофильных межклеточной адгезии с помощью плазматической мембраны клетки адгезии молекул ; • NMDA - рецепторов глутамата кластеризация ; • установление локализации белка ; • нейрон клетка-клетка адгезией ; • гамма- кластеризация аминомасляной кислоты рецепторов ; • нейронный сигнальная трансдукция ; • gephyrin кластеризация участвует в постсинаптической плотности сборки ; • белок постсинаптической плотности 95 кластерной ; • обучения ; • регулирования активности рецепторов АМРА ; • отрицательного регулирования филоподий сборка ; • пресинаптической мембрана в сборе ; • регуляция активности рецепторов NMDA ; • поведение вокализации ; • нейролигины кластеризация участвует в постсинаптической мембраны сборки ; • поведение взрослых ; • положительное регулирование синаптической передачи, глутаматергическая ; • постсинаптической мембраны в сборе ; • клеточная адгезия ; • ангиогенез ; • положительное регулирование возбуждающего постсинаптического потенциала ; • социальное поведение ; • гуанилат - киназы-ассоциированной PROTEI п кластеризация ; • синапса сборка ; • белково-комплекс , содержащий сборку участвует в синапс созревания ; • синаптических везикул кластеризация ; • локализации белка синапса ; • трансдукции сигнала ; • мозжечковая дифференцировки клеток гранулу ; • положительное регулирование синапсе сборки ; • положительное регулирование пресинаптической активной зоны сборки ; • положительное регулирование локализация белка на плазматической мембране ; • позитивная регуляция экспрессии гена ; • негативная регуляция экспрессии гена ; • позитивная регуляция передачи сигналов протеинкиназы A ; • развитие проекции нейронов ; • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина ; • позитивная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста фибробластов ; • позитивная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B ; • позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2 ; • клеточный ответ на ион кальция ; • позитивная регуляция активности протеинкиназы C ; • голосовое обучение ; • химическая синаптическая передача ; • регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на глюкозу ОСЭ стимул ; • аксоны ; • предымпульс ингибирование ; • нервно - мышечной контрольный процесс баланс ; • положительное регулирование синапсов созревания ; • GO: 0010554 нейромедиатора секреция ; • регулирование груминг поведения ; • синаптических мембраны адгезия ; • регуляция синаптической везикулы цикла ; • регулирование постсинаптической специализации сборки ; • регулирование presynapse сборка ; • регуляция сборки постсинаптической плотности ; • транссинаптическая передача сигналов эндоканнабиноидом;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	9378
	18189
	ENSG00000179915
	ENSMUSG00000024109
	P58400 ; Q9ULB1 ; Q49A31
	P0DI97 ; Q9CS84
NM_001135659 ; NM_004801 ; NM_138735 ; NM_001320156 ; NM_001320157;
	NM_001330077 ; NM_001330078 ; NM_001330079 ; NM_001330081 ; NM_001330082 ; NM_001330083 ; NM_001330084 ; NM_001330085 ; NM_001330086 ; NM_001330087 ; NM_001330088 ; NM_001330089 ; NM_001330090 ; NM_001330091 ; NM_001330092 ; NM_001330093 ; NM_001330094 ; NM_001330095 ; NM_001330096 ; NM_001330097
NM_020252 ; NM_177284 ; NM_001346957 ; NM_001346958 ; NM_001346959;
	NM_001346960 ; NM_001346961 ; NM_001346962 ; NM_001347419
NP_001129131 ; NP_001307085 ; NP_001307086 ; NP_001317006 ; NP_001317007;
	NP_001317008 ; NP_001317010 ; NP_001317011 ; NP_001317012 ; NP_001317013 ; NP_001317014 ; NP_001317015 ; NP_001317016 ; NP_001317017 ; NP_001317018 ; NP_001317019 ; NP_001317020 ; NP_001317021 ; NP_001317022 ; NP_001317023 ; NP_001317024 ; NP_001317025 ; NP_001317026 ; NP_004792 ; NP_620072 ; NP_001129131.1 ; NP_004792.1 ; NP_620072.1 ; NP_004792.1 ; NP_004792.1 ; NP_620072.1
NP_001333886 ; NP_001333887 ; NP_001333888 ; NP_001333889 ; NP_001333890;
	NP_001333891 ; NP_001334348 ; NP_064648 ; NP_796258 ; NP_064648.3 ; NP_796258.2
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Нейрексин-1-альфа является белком , который в организме человека кодируется нейрексин-1 ген .

Нейрексины - это семейство белков, которые функционируют в нервной системе позвоночных как молекулы клеточной адгезии и рецепторы. Они кодируются несколькими несвязанными генами, два из которых, NRXN1 и NRXN3 , являются одними из крупнейших известных генов человека. Три гена (NRXN1-3) используют два альтернативных промотора и включают множество альтернативно сплайсированных экзонов для генерации тысяч различных транскриптов мРНК и изоформ белков. Большинство транскриптов продуцируются вышестоящим промотором и кодируют изоформы альфа-нейрексина; гораздо меньшее количество транскриптов продуцируется нижележащим промотором и кодирует изоформы бета-нейрексина. Альфа-нейрексины содержат последовательности, подобные эпидермальному фактору роста (EGF-подобные), и домены ламинина G, и было показано, что они взаимодействуют с нейрексофилинами . Бета-нейрексины лишены EGF-подобных последовательностей и содержат меньше доменов ламинина G, чем альфа-нейрексины.

Функция

Нейрексины - это пресинаптические молекулы адгезии мембранных клеток, которые связываются в первую очередь с нейролигинами , белками, которые связаны с аутизмом . Аутизм характеризуется широким спектром социальных и когнитивных нарушений, которые частично объясняются неправильной синаптической связью между нейронами . Это отсутствие связи часто связано с мутациями в NRXN1. Структурные варианты NRXN1a (neurexin1 alpha) согласуются с мутациями, предрасполагающими к аутизму. Эти альфа-нейрексины участвуют в коммуникации через механизмы связывания кальциевых каналов и экзоцитоза везикул, чтобы гарантировать правильное высвобождение нейротрансмиттеров. Они особенно необходимы для высвобождения глутамата и ГАМК. Последствия участия нейрексина в аутизме были определены посредством делеции в кодирующих экзонах NRXN1a, особенно на моделях мышей с нокаутом. Эти мыши показали нарушение социального функционирования, снижение двигательной реакции в новых ситуациях и усиление агрессивного поведения у самцов. Социальное функционирование имело большое значение для этого гена и его связи с расстройством аутистического спектра .

Геномика

Ген находится в единственной копии на коротком плече хромосомы 2 (2p16.3). Ген имеет длину 1112 187 оснований, расположен на цепи Крика (минус) и кодирует белок из 1477 аминокислот (молекулярная масса 161,883 кДа).

Мутации этого гена, которые прерывают его экспрессию, связаны с шизофренией , аутизмом и умственной отсталостью ( мутации NRXN1 и расстройства мозга ).

Взаимодействия

Было показано, что NRXN1 взаимодействует с NLGN1 .

использованная литература

дальнейшее чтение

Missler M, Südhof TC (1998). «Нейрексины: три гена и 1001 продукт». Тенденции Genet . 14 (1): 20–26. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (97) 01324-3 . PMID 9448462 .
Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Res . 9 (3): 99–106. DOI : 10.1093 / dnares / 9.3.99 . PMID 12168954 .
Ушкарев Ю.А., Петренко А.Г., Гепперт М, Зюдхоф ТЦ (1992). «Нейрексины: белки поверхности синаптических клеток, связанные с рецептором альфа-латротоксина и ламинином». Наука . 257 (5066): 50–56. Bibcode : 1992Sci ... 257 ... 50U . DOI : 10.1126 / science.1621094 . PMID 1621094 .
Ихченко К., Нгуен Т., Зюдхоф ТЦ (1996). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . J. Biol. Chem . 271 (5): 2676–2682. DOI : 10.1074 / jbc.271.5.2676 . PMID 8576240 .
Петренко А.Г., Ульрих Б., Мисслер М. и др. (1996). «Структура и эволюция нейрексофилина» . J. Neurosci . 16 (14): 4360–9. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.16-14-04360.1996 . PMC 6578849 . PMID 8699246 .
Hata Y, Butz S, Südhof TC (1996). «CASK: новый гомолог dlg / PSD95 с N-концевым кальмодулин-зависимым протеинкиназным доменом, идентифицированным взаимодействием с нейрексинами» . J. Neurosci . 16 (8): 2488–94. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.16-08-02488.1996 . PMC 6578772 . PMID 8786425 .
Перин М.С. (1996). «Мотивы зеркального отображения опосредуют взаимодействие COOH-конца множественных синаптотагминов с нейрексинами и кальмодулином». Биохимия . 35 (43): 13808–13816. DOI : 10.1021 / bi960853x . PMID 8901523 .
Нгуен Т., Зюдхоф TC (1997). «Связывающие свойства нейролигина 1 и нейрексина 1beta обнаруживают функцию гетерофильных молекул клеточной адгезии» . J. Biol. Chem . 272 (41): 26032–26039. DOI : 10.1074 / jbc.272.41.26032 . PMID 9325340 .
Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Res . 5 (1): 31–39. DOI : 10.1093 / dnares / 5.1.31 . PMID 9628581 .
Missler M, Hammer RE, Südhof TC (1999). «Связывание нейрексофилина с альфа-нейрексинами. Один домен LNS функционирует как независимо сворачивающаяся единица связывания лиганда» . J. Biol. Chem . 273 (52): 34716–34723. DOI : 10.1074 / jbc.273.52.34716 . PMID 9856994 .
Клейдерлейн Дж. Дж., Ниссон П. Е., Джесси Дж. И др. (1999). «Повторы CCG в кДНК головного мозга человека». Гм. Genet . 103 (6): 666–673. DOI : 10.1007 / s004390050889 . PMID 9921901 . S2CID 23696667 .
Бидерер Т., Зюдхоф TC (2001). «Минты как адаптеры. Прямое связывание с нейрексинами и рекрутирование munc18» . J. Biol. Chem . 275 (51): 39803–39806. DOI : 10.1074 / jbc.C000656200 . PMID 11036064 .
Королл М, Ратьен Ф.Г., Фолькмер Х. (2001). «Молекула распознавания нервных клеток нейрофасцин взаимодействует с синтенином-1, но не с синтенином-2, оба из которых проявляют самоассоциирующую активность» . J. Biol. Chem . 276 (14): 10646–10654. DOI : 10.1074 / jbc.M010647200 . PMID 11152476 .
Фукуда М, Микошиба К (2001). «Характеристика белка KIAA1427 как атипичного синаптотагмина (Syt XIII)» . Biochem. Дж . 354 (Pt 2): 249–57. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3540249 . PMC 1221650 . PMID 11171101 .
Фукуда М, Микошиба К (2001). «Синаптотагмин-подобный белок 1-3: новое семейство тандемных C2-белков С-концевого типа». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 281 (5): 1226–1233. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.4512 . PMID 11243866 .
Роуэн Л., Янг Дж., Бердитт Б. и др. (2002). «Анализ генов нейрексинов человека: альтернативный сплайсинг и создание разнообразия белков». Геномика . 79 (4): 587–597. DOI : 10.1006 / geno.2002.6734 . PMID 11944992 .
Табучи К., Südhof TC (2002). «Структура и эволюция генов нейрексинов: понимание механизма альтернативного сплайсинга». Геномика . 79 (6): 849–859. DOI : 10.1006 / geno.2002.6780 . PMID 12036300 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Genome Res . 12 (11): 1773–1784. DOI : 10.1101 / gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P58400 (Neurexin-1-beta) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Languages

In other projects