Молекулярная патологическая эпидемиология - Molecular pathological epidemiology
Молекулярная патологическая эпидемиология ( MPE , также молекулярная патологическая эпидемиология ) - это дисциплина, сочетающая эпидемиологию и патологию . Это определяется как «эпидемиология молекулярной патологии и неоднородности заболевания». Патология и эпидемиология преследуют одну и ту же цель - выяснение этиологии заболевания, и MPE стремится достичь этой цели на молекулярном, индивидуальном и популяционном уровнях. Как правило, MPE использует ресурсы и данные по патологии тканей в рамках существующих эпидемиологических исследований. Молекулярная эпидемиология в широком смысле охватывает MPE и молекулярную эпидемиологию обычного типа с использованием традиционных систем обозначения болезней.
Болезнь процесс
Данные проектов Атласа генома рака указывают на то, что эволюция болезни - это по своей сути неоднородный процесс. У каждого пациента есть уникальный процесс заболевания («принцип уникального заболевания»), учитывая уникальность экспозома и его уникальное влияние на молекулярный патологический процесс. Эта концепция была принята в клинической медицине наряду с точной медициной и персонализированной медициной .
Методология
В MPE исследователи анализируют взаимосвязь между воздействиями (например, окружающей средой, питанием, образом жизни и генетическими факторами); изменения в клеточных или внеклеточных молекулах (молекулярные сигнатуры заболевания); и развитие и прогрессирование болезни. Исследователи могут анализировать геном , метилом , эпигеном , метаболом , транскриптом , протеом , микробиом , иммунитет и интерактом . Предполагаемый фактор риска может быть связан с определенными молекулярными сигнатурами.
Исследование MPE позволяет идентифицировать новый биомаркер для потенциального клинического применения с использованием крупномасштабных популяционных данных (например, мутации PIK3CA при колоректальном раке для отбора пациентов для лечения аспирином ). Подход MPE может быть использован после полногеномного исследования ассоциации (GWAS), названного «подходом GWAS-MPE». Детальное фенотипирование конечной точки заболевания можно проводить с помощью молекулярной патологии или суррогатной гистопатологии или иммуногистохимического анализа пораженных тканей и клеток в GWAS.
В качестве альтернативного подхода варианты потенциального риска, идентифицированные GWAS, могут быть исследованы в сочетании с анализом молекулярной патологии на пораженных тканях. Этот подход GWAS-MPE может дать не только более точные оценки эффекта, даже более серьезные эффекты для конкретных молекулярных подтипов заболевания, но также понимание патогенеза путем связывания генетических вариантов с молекулярными патологическими признаками заболевания. Поскольку молекулярная диагностика становится рутинной клинической практикой, данные молекулярной патологии могут помочь в эпидемиологических исследованиях.
История
MPE начинался как анализ факторов риска (например, курение) и молекулярных патологических данных (например, мутации онкогена KRAS G12C при карциноме легких).
Исследования по изучению взаимосвязи между воздействием и молекулярными патологическими признаками заболевания (в частности, рака) становились все более распространенными в течение 1990-х и начала 2000-х годов.
Для использования молекулярной патологии в эпидемиологии не хватало стандартизированных методологий и руководств, а также междисциплинарных экспертов и программ обучения. Исследование MPE потребовало новой концептуальной основы и методологии ( эпидемиологический метод ), потому что MPE исследует неоднородность в переменной результата .
Термин «молекулярная патологическая эпидемиология» был использован Шуджи Огино и Меиром Штампфером в 2010 году. Конкретные принципы MPE были разработаны после 2010 года. Парадигма MPE широко используется во всем мире и является предметом международных конференций. Серия международных совещаний по молекулярной патологической эпидемиологии (MPE) была открыта для исследовательского сообщества всего мира, второе и третье совещания были проведены в Бостоне в декабре 2014 года и мае 2016 года, соответственно.
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение
- Гао С (2016). «Молекулярная патологическая эпидемиология при сахарном диабете и риск гепатоцеллюлярной карциномы» . Всемирный журнал гепатологии . 8 (27): 1119–1127. DOI : 10,4254 / wjh.v8.i27.1119 . PMC 5037325 . PMID 27721917 .
- Rescigno T, Micolucci L, Tecce MF, Capasso A (2017). «Биоактивные питательные вещества и нутригеномика при возрастных заболеваниях» . Молекулы (Базель, Швейцария) . 22 (1): 105. DOI : 10.3390 / modules22010105 . PMC 6155887 . PMID 28075340 .
- Патил Х., Саксена С.Г., Барроу С.Дж., Канвар-младший, Капат А., Канвар РК (2017). «В погоне за мечтой о персонализированной медицине с помощью проверки биомаркеров колоректального рака». Открытие наркотиков сегодня . 22 (1): 111–119. DOI : 10.1016 / j.drudis.2016.09.022 . PMID 27693431 .