Methylacidiphilum fumariolicum -Methylacidiphilum fumariolicum
Methylacidiphilum fumariolicum | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Класс: |
Неклассифицированный
|
Порядок: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: |
М. fumariolicum
|
Биномиальное имя | |
Methylacidiphilum fumariolicum Х. Оп ден Камп и др., 2007 г.
|
|
Тип штамма | |
SolV |
Methylacidiphilum fumariolicum - автотрофная бактерия, впервые описанная в 2007 году и растущая в вулканических бассейнах недалеко от Неаполя , Италия . Он растет в грязи при температуре от 50 ° C до 60 ° C и кислотном pH 2–5. Он способен окислять газообразный метан . Он использует аммоний , нитрат или атмосферный азот в качестве источника азота и связывает углекислый газ .
В связи с наличием лантаноидов зависимого метанола дегидрогеназа фермента, его рост строго зависит от обилия редкоземельных металлов .
Нет биотические взаимодействия между М. fumariolicum и другими организмами , не известны, вероятно , из - за экстремальные условия потребности бактерий, чтобы расти.
Биология
Геном
Геном M. fumariolicum имеет размер 2,36 Мбит / с с содержанием GC 40,9% и 2283 генами, кодирующими белок.
Метаболизм
Энергия получается окислением метана до метанола и ферментом метанолдегидрогеназой, который строго зависит от использования редкоземельных металлов в качестве кофакторов . Обычно он использует лантан в качестве важного кофактора, но было показано, что его можно заменить другими лантаноидами, такими как церий , празеодим или неодим, без отрицательных эффектов, а самарием , европием или гадолинием только замедляя скорость роста бактерий.
Он использует цикл Кальвина-Бенсона-Бассема для фиксации углекислого газа и использования его в качестве источника углерода. Фактически, концентрация CO 2 ниже 0,3% (об. / Об .) Препятствует любому росту M. fumariolicum .
M. fumariolicum оказался более чувствительным к кислороду, чем большинство других протеобактериальных метанотрофов . Вероятно , из - за того , что он использует нитрогеназной во время фиксации азота , который , как известно, чувствительный к кислороду .