Список баз данных неврологии - List of neuroscience databases
Доступен ряд сетевых нейробиологических баз данных, которые предоставляют информацию об экспрессии генов , нейронах , макроскопической структуре мозга, а также неврологических или психических расстройствах. Некоторые базы данных содержат описательные и числовые данные, некоторые - о функциях мозга, другие предлагают доступ к «необработанным» данным визуализации, таким как посмертные срезы мозга или изображения 3D МРТ и фМРТ . Некоторые фокусируются на человеческом мозге, другие - на нечеловеческом.
По мере роста количества баз данных, которые стремятся распространять информацию о структуре, развитии и функциях мозга, растет потребность в сопоставлении самих этих ресурсов. В результате в настоящее время существуют базы данных нейробиологических баз данных, некоторые из которых насчитывают более 3000 записей.
Базы данных неврологии
| Имя | Описание | Организм | Уровень (ген, нейрон, макроскопический) | Данные (МРТ, фМРТ, изображения, описательные, числовые) | Беспорядок | Зарегистрироваться для просмотра данных? | Ref. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Атлас мозга Аллена | Атлас, окрашенные срезы головного мозга, показывающие развитие и экспрессию генов | Мышь, Человек | Макроскопический, Ген | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Инициатива по нейровизуализации болезни Альцгеймера (ADNI) | Структурные изображения МРТ | Человек | Макроскопический | Наборы данных МРТ | Здоровье и болезнь Альцгеймера | да | ||
| Большой мозг | Трехмерная реконструкция головного мозга из окрашенных гистологических срезов с изотропным разрешением 20 микрон | Человек | Микроскопический | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Данные фМРТ и МРТ BIRN | ФМРТ, МРТ и атласы мозга человека и мыши | Мышь, Человек | Многоуровневый: области мозга, связи, нейроны, паттерны экспрессии генов. | Наборы данных МРТ, наборы данных фМРТ | Здоровые, Пожилые | Нет | ||
| База данных нейровизуализации биполярного расстройства | Мета-анализ и база данных МРТ-исследований | Человек | Макроскопический | Описательный, числовой | Биполярное расстройство | Нет | ||
| Система управления архитектурой мозга | Интернет-ресурс с информацией о нейронных схемах | Крыса, мышь, человек | Многоуровневый: области мозга, связи, нейроны, паттерны экспрессии генов. | Описательный, числовой | Здоровый | Нет | ||
| Облако Мозга | Экспрессия генов в префронтальной коре головного мозга человека | Человек | Паттерны экспрессии генов | Описательный, числовой | Здоровый | Нет | ||
| Мозг-КОД | Мультимодальная платформа для комплексных исследований в области нейробиологии и данных Института мозга Онтарио . | Человек, Животное | Мультимодальные наборы данных (клинические, визуализационные, молекулярные и т. Д.) | Описательные, числовые, визуализационные, молекулярные, генетические | Нейроразвитие, церебральный паралич, эпилепсия, депрессия, нейродегенерация, сотрясение мозга | да | ||
| Brain-Development.org | Структурные МРТ-изображения и атласы | Человек | Макроскопический | Наборы данных МРТ | Плоды, здоровые и недоношенные новорожденные | да | ||
| Braingraph.org | Braingraphs вычисленный из проекта Human Коннекта данных | Человек | Макроскопический, до 1015 узлов | ориентированные и неориентированные графы в анатомически аннотированном формате GraphML | Здоровый | Нет | ||
| Braininfo | Атлас, схематический атлас Macaca fascicularis | Макака | Макроскопический | Схематические изображения | Здоровый | да | ||
| Платформа интерфейса мозг-машина | Различные типы данных, связанные с интерфейсом мозг-машина | Человек, Обезьяна | Макроскопический, Нейрон | Изображения, числовые | Здоровый | Нет | ||
| BrainMap.org | база данных координат фМРТ | Человек | Макроскопический | Описательный | Здоровый | да | ||
| BrainMaps | Атлас, окрашенные срезы головного мозга высокого разрешения | Человек, примат и непримат (всего 14 видов) | Нейрон и макроскопия | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Портал данных Brain / MINDS | Атлас, МРТ in-vivo и ex-vivo, записи ЭКоГ | Обыкновенная Мартышка, Человек | Макроскопический | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| База данных Бреде | База данных координат фМРТ и ПЭТ | Человек | Макроскопический | Описательный | Здоровый | Нет | ||
| Brainmuseum.org / Банк биоразнообразия мозга МГУ | Атлас, окрашенные срезы головного мозга и изображения МРТ | Человек и 62 других вида | Макроскопический | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Брейномика / Локализатор | ФМРТ и МРТ, поведенческие данные | Человек | Макроскопический | Изображения, числовые | Здоровый | Нет | ||
| Подкорковый атлас Калифорнийского технологического института | МРТ | Человек | Макроскопический | МРТ | Здоровый | Нет | ||
| Кембриджский центр старения и неврологии (Cam-CAN) | Данные МРТ, фМРТ, МЭГ для ~ 700 здоровых взрослых людей в возрасте 18-88 лет | Человек | Макроскопический | Изображения, Описательные, Числовые | Здоровый | Нет | ||
| Архив изображений рака | МРТ, КТ и ПЭТ-визуализация онкологических больных с подтверждающими клиническими данными (во многих случаях) | Человек | Макроскопический | Изображения, Описательные, Числовые | Рак | Нет | ||
| База данных транскриптомов развития мозжечка | Атлас, окрашенные срезы мозга мышей, показывающие развитие мозжечка и экспрессию генов | Мышь | Макроскопический, Ген | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Совместные исследования в области вычислительной нейробиологии CRCNS.org | Многие виды результатов нейробиологии, актуальные для моделирования | Человек и несколько других видов | Мультимасштаб | Спайковые поезда, LFP, MUA, MRI | Здоровый | да | ||
| База данных для экспериментов и моделей (DREAM) | Получение данных (поведенческие, обобщение, адаптация, обучение, спайк, фМРТ, неопределенность) | Человек и обезьяна | Макроскопический | Кинематика, спайк, фМРТ | Здоровый | да | ||
| Центр данных фМРТ | Наборы данных фМРТ из опубликованных исследований | Человек | Макроскопический | наборы данных фМРТ | Здоровый | да | ||
| Проект GLIMPS (Визуализация глюкозы при паркинсоническом синдроме) | Международная база данных нейродегенеративных заболеваний по сканированию FDG-PET | Человек | Макроскопический | Изображения FDG-PET | Болезнь Паркинсона (БП), болезнь Альцгеймера (БА), множественная системная атрофия (МСА), прогрессирующий надъядерный паралич (ПСП) и т. Д. | да | ||
| Портал гиппокампа | Схемотехника, нейронные типы, электрофизиология | Взрослый человек | Нейрон | Морфология клеток, электрофизиология, состав области, связь | Здоровый | да | ||
| Международная база данных по электрофизиологии эпилепсии (IEEG.org) | ЭЭГ, метаданные, визуализация, аннотации данных | Люди и животные модели эпилепсии | ЭЭГ, локальные поля, микро-ЭКоГ | Электрофизиология | Нездоровый, несколько здоровый | да | ||
| Международная инициатива по обмену данными нейровизуализации (INDI) | Функциональные данные о подключении из множества разных групп | Беспозвоночные (всего 47 видов) | Макроскопический | Функциональная связь | Здоровый, нездоровый | да | ||
| Платформа мозга беспозвоночных | Фотографии рассечения нервной системы беспозвоночных. | Беспозвоночные (всего 47 видов) | Макроскопический | Фото | Здоровый | Нет | ||
| Фантом человека in vivo | Данные МРТ сверхвысокого разрешения одного участника, включая 150 мкм ToF-ангиографию, 250 мкм T1-взвешенный MPRAGE, 330 мкм QSM, 450 мкм T2-взвешенный TSE, 800 мкм DTI, один час непрерывной rs-fMRI 1,8 мм и структурные данные, полученные более более десяти лет | Человек | Мезоскопический | Структурная МРТ с различными контрастами, МРТ микроструктуры и функциональная МРТ | Здоровый | Нет | ||
| Атлас JuBrain | Вероятностные цитоархитектонические 3D-карты мозга человека | Человек | Мезоскопический | Структурные | Здоровый | Нет | ||
| Кимата Атлас | Функциональный атлас коры головного мозга человека | Человек | Макроскопический | Функциональный | Здоровый | Нет | ||
| База данных нейровизуализации тяжелого депрессивного расстройства | Мета-анализ и база данных МРТ-исследований | Человек | Макроскопический | Описательный, числовой | Большое депрессивное расстройство | Нет | ||
| Генный атлас мартышек | Экспрессия генов во всем мозге обыкновенной мартышки | Обыкновенная мартышка | Макроскопический, Ген | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| Библиотека мозга мыши | Атлас, окрашенные срезы из мозга мыши | Мышь | Макроскопический | Изображений | Здоровый | Нет | ||
| NeuroData | Объемные наборы данных, атласы и исследования коннектомики | Несколько | Мультимасштаб | Изображения (3D, 4D) | Различный | Нет | ||
| Neuroelectro.org | Электрофизиология нейронов | Человек, другие | Нейрон | Электрофизиологические свойства и данные | Здоровый | Нет | ||
| Neuromorpho.org | 3D модели реальных нейронов | Человек, крыса , мышь , обезьяна , другие | Нейрон | Изображения и 3D-данные | Здоровый | Нет | ||
| Neuromorphometrics.com | МРТ-сканирование мозга с ручной пометкой | Человек | Макроскопический | Т1-взвешенная МРТ, маркированные объемы | Здоровый | Нет | ||
| NeuronDB | База данных свойств и классификации нейронов | Человек | Нейрон | Описательный | Здоровый | Нет | ||
| Совместная работа по инструментам и ресурсам нейровизуализации (NITRC) | Отмеченное наградами бесплатное сотрудничество с более чем 1000 программными инструментами нейроинформатики, наборами данных для визуализации и ресурсами сообщества, включая форумы и мероприятия. | Человек, мышь, крыса, другое | Микроскопический, макроскопический | Наборы данных | Здоровые и больные | Нет | ||
| Серия исследований изображений открытого доступа (OASIS) | Структурные изображения МРТ | Человек | Макроскопический | Наборы данных МРТ | Здоровье и болезнь Альцгеймера | да | ||
| Открыть проект Connectome | База данных различных схемотехнических схем и наборов данных нейровизуализации, включая объемные наборы данных, атласы и исследования коннектомики | Человек, мышь, летучая мышь, данио, насекомое, другое | Многоуровневый: области мозга, связи, нейроны, паттерны экспрессии генов. | Изображения и 3D-данные | Здоровый | Нет | ||
| OpenNeuro | Большой и разнообразный набор исходных данных из различных исследований, распространяемых по разрешительным лицензиям ( CC0 и CC-BY ). Все наборы данных отформатированы в соответствии с одним и тем же форматом ( структура данных изображений мозга ) и доступны через Amazon S3 . | Человек | Макроскопический | Наборы данных функциональной, структурной, диффузионной МРТ и магнитоэнцефалографии | Здоровые и различные болезни | Нет | ||
| Открытый архив MEG (OMEGA) | Магнитоэнцефалография , наборы данных структурной МРТ и демографические данные | Человек | Макроскопический | МЭГ, наборы данных МРТ T1, демографические данные | Здоровый, СДВГ , черепно-мозговая травма | да | ||
| Репозиторий PAIN | Структурные, диффузионные и функциональные наборы данных МРТ | Человек | Человеческий макроскопический | Наборы данных и метаданные МРТ | Здоровые и болезненные состояния | да | ||
| Атлас мозга свиньи | Атлас мозга свиньи - это трехмерный усредненный мозг и атлас новорожденного поросенка (Sus scrofa) на основе МРТ. | Свинья (Sus scrofa) | Макроскопический | Структурная МРТ | Здоровый | да | ||
| База данных типов клеток приматов | PrimateDatabase.com, общедоступный веб-архив записей внутриклеточных патч-зажимов и высокодетальных трехмерных цифровых реконструкций морфологии нейронов. | Нечеловеческий примат и человек | Нейрон | Электрофизиология, морфология и трехмерные реконструкции | Здоровый | Нет | ||
| SchizConnect | SchizConnect - это открытая общедоступная виртуальная база данных для поиска и загрузки изображений нейровизуализации шизофрении (МРТ) и связанных данных. | Человек | Макроскопический | Структурные, диффузионные и функциональные наборы данных МРТ, когнитивные и клинические оценки | Шизофрения (+ братья и сестры), Биполярное расстройство, Контроль (+ братья и сестры) | да | ||
| База данных Храмовой ЭЭГ | Более 30 000 клинических ЭЭГ и сопроводительных отчетов невролога | Человек | Макроскопический | ЭЭГ | Здоровые и различные болезни | да | ||
| Набор данных МРТ всего мозга сверхвысокого разрешения с T1-взвешиванием | Т1-взвешенные данные МРТ, полученные с использованием предполагаемой коррекции движения со сверхвысоким изотропным разрешением 250 мкм. | Человек | Мезоскопический | Набор данных структурной МРТ, включая необработанные и обработанные данные сканера | Здоровый | Нет | ||
| UNC-Wisconsin База данных МРТ-резус-фактора нервного развития | Структурные и диффузно-взвешенные изображения МРТ в Native и Atlas Space | Макака | Макроскопический | Наборы данных МРТ | Здоровый | Нет | ||
| Атлас всего мозга | Атлас, структурные изображения МРТ и изображения ПЭТ | Человек | Макроскопический | Изображений | Здоровые и различные болезни | Нет | ||
| NeuroVault | Неограниченные статистические карты из исследований МРТ и ПЭТ. | Человек | Макроскопический | Изображений | Здоровые и различные болезни | Нет |
Базы данных неврологических баз данных
| Имя | Описание | Организм | Уровень (ген, нейрон, макроскопический) | Данные (МРТ, фМРТ, изображения, описательные, числовые) | Беспорядок | Зарегистрироваться для просмотра данных? | Ref. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Информационная структура по неврологии | Мета-база данных по нейробиологии, включающая более 100 баз данных. | Человек, мышь, крыса, червь | Микроскопический, макроскопический | Наборы данных | Здоровые и больные | Нет |
Агрегаторы статей по нейробиологии
Канал по неврологии на RightRelevance.