HLA-DQ6 - HLA-DQ6

HLA-DQ6
( MHC Class II , антиген клеточной поверхности DQ )
DQ Illustration.PNG
Иллюстрация HLA-DQ со связанным пептидом
Цис-гаплотип Гаплотип
изоформа подтип DQA1 DQB1
DQ α 1,3 β 6,1 DQ6.1 * 0103 * 0601
DQ α 1,2 β 6,2 DQ6.2 * 0102 * 0602
DQ α 1,3 β 6,3 DQ6.3 * 0103 * 0603
DQ α 1,2 β 6,4 DQ6.4 * 0102 * 0604
редкие гаплотипы
DQ α 1,2 β 6,3 DQ6.3v * 0102 * 0603
DQ α 1,3 β 6,2 DQ6.2v * 0103 * 0602
DQ α 1,2 β 6,9 DQ6.9 * 0102 * 0609


HLA-DQ6 (DQ6) представляет собой серотип человеческого лейкоцитарного антигена в  группе серотипов HLA-DQ (DQ). Серотип определяется по распознаванию антителом субнабора β 6 β-цепей DQ. Β-цепь изоформ DQ кодируется локусом HLA-DQB1, а DQ6 кодируется группой аллелей HLA-DQB1 * 06 . Эта группа в настоящее время содержит много общих аллелей, из которых DQB1 * 0602 является наиболее распространенным. HLA-DQ6 и DQB1 * 06 почти синонимы по значению. DQ6 бета-цепи в сочетании с альфа-цепей, кодируемых генетически связанных HLA-DQA1 аллелями, с образованием цис - гаплотипов изоформы. Однако для DQ6 спаривание цис-изоформ происходит только с α-цепями DQ1 . Есть много гаплотипов DQ6.

Серология

Распознавание DQ6, DQ1 и DQ5 некоторых аллелей Some DQB1 *
DQ6 DQ1 DQ5 N
аллель % % % размер (N)
* 0601 64 23 675
* 0602 67 30 1 5151
* 0603 62 23 2 2807
* 0604 59 27 2 1592
* 0605 76 13 358
* 0609 48 32 3 149

Аллели

HLA DQB1 * 0601 частоты
частота
исх. численность населения (%)
Индиг. Австралийский мыс Йорк 31,3
Индиг. Австралийка Кимберли 30,5
Науру 28,4
Фиджи Вити-Леву 26,3
Индия Бомбей 26,3
Низменность Папуа-Новой Гвинеи 26,0
Китай Гуйчжоу, пров. Мяо 25,9
Папуа-Новая Гвинея Маданг 23,1
Кирибати 22,6
Япония 22,0
Индонезия Нуса Тенгара 19,2
Индия Северные индусы 18,7
Япония Хоккайдо Ваджин 17.0
Уттар-Прадеш индуистский 15,1
PNG низменность Wosera 14.1
Западное Самоа и Токелау 13,7
Пакистанские калаши 13,0
Индия Лакхнау 12,9
Китай Ухань 12,8
Южная Корея (4) 11,4
PNG Хайленд 10.9
Индия Дели 9.0
Иран Белудж 8.0
Монголия Халха 5.5
Ливан Юхмур 4.3
Тунис Ганнуш 4.3
Польша Wielkopolska 4.0
Мексика масатеканцы 3.5
Испания Э. Андалусия 2.0
Центральная Италия 1.9
Юго-Восток Франции 1.6
Англия европеоид 1.1
Южная Ирландия 0,2
Италия Сардиния 0,1
Бразилия Гуарани Кайова 0,0
Камерун Саа 0,0

DQB1 * 0601

DQB1 * 0601 обычно связан с DQA1 * 0103 как гаплотип 6.1 . Этот гаплотип более распространен в Японии и других частях Восточной Азии.

HLA DQB1 * 0602 частоты
частота
исх. численность населения (%)
Испания Пас Вэлли 31,5
Камерун Саа 30,8
Конго Киншаса Банту 30,0
PNG Э. Хайлендс Горока 29,8
Сибирь Кеть Нижний Енисей 29,4
Испания Северный Кабуэрниго 28,9
Россия Архангельск Поморы 24,7
Испания Северная Кантабрия 24,7
Южная Ирландия 19,6
Бельгийский (2) 19,4
Сибирь Кушун Бурятский 18,0
Финляндия 17,1
Сибирь Деревня Кец Суламай 17.0
Польша Wielkopolska 16,9
Немецкий Эссен 16,7
Sp. Баскская долина Арратия 16,7
Дания 16,6
Франция Ceph 15,7
Кения 14,6
Англия европеоид 14,4
Швеция 14.1
Франция Ренн 13,8
Тунис Матмата Бербер 11,7
Иордания Амман 10,7
Япония Хоккайдо Ваджин 10.0
Саудовская Аравия Guraiat & Hail 8,4
Япония Центральная 8,2
Науру 8,2
Грузия Сванети Сваны 8.1
Юго-Восток Франции 8.0
Эфиопия Амхара 7,7
Алжир Оран 7,6
Словения 7,5
Южная Корея (1) 7,4
Япония Фукуока 6.4
Пакистанские калаши 5,8
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ 5,4
Низменность Папуа-Новой Гвинеи 5.2
Монголия Халх Улан-Батор 4.9
Испания Мурсия 4.8
Индия Бомбей 4.2
Япония 4.0
Греция (2) 3.3
Израильские арабы 2.3
Вьетнам Ханой Кинь 2.0
Евреи Израиля 1.5
Монголия Хотон Тариалан 1.2
США Аляска коренные жители юпиков 0,8
Мексика Mixtec Oaxaca 0,5
Италия Сардиния pop2 0,1

DQB1 * 0602

DQB1 * 0602 обычно связан с DQA1 * 0102 с образованием гаплотипа 6.2 . DQ6.2 распространен из Центральной Азии в Западную Европу, * 0602 также связан с DQA1 * 0103 в некоторых частях Азии.

HLA DQB1 * 0603 частоты
частота
исх. численность населения (%)
Грузия Сванети Сваны 14,4
Франция Запад 11.0
Нидерланды 10,6
Немецкий Эссен 9.2
Чехия 9.0
Испания Мурсия 8,7
Словакия 8,4
Дания 8,3
Индия Лакхнау 8,3
Иордания Амман 8,3
Франция Ренн 8.1
Польша Wielkopolska 8.0
Саудовская Аравия Guraiat & Hail 8.0
Тунис Джерба ​​Бербер 7,8
Уганда Муганда Баганда 7,4
Испания Северная Кантабрия 7.2
Финляндия 7.1
Франция Юг 6.9
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ 6.5
Россия Северо-Запад славянский 6.0
Ирландия Донегол 5,3
Греция (3) 5.2
Северная Ирландия (2) 4.9
Италия Рим 4.0
CAR или пигмеи 3,6
Ливан Кафар Зубиан 3.2
Швеция 2,5
Таиланд 2.1
Китай Ухань 1,7
Япония (2) 1.0
Южная Корея (3) 0,9
Малайзия 0,6

DQB1 * 0603

DQB1 * 0603 обычно связан с DQA1 * 0103 как 6.3 и распространен из Центральной Азии в Западную Европу, * 0603 также связан с DQA1 * 0102 в некоторых частях Азии. В Европе наиболее распространен в Нидерландах.

HLA DQB1 * 0604 частоты
частота
исх. численность населения (%)
Эфиопия Амхара 10,7
Руанда кигали хуту и ​​тутси 10,7
Эфиопия Оромо 10.2
Япония 8.0
Саудовская Аравия Guraiat & Hail 8.0
Иран Йезд зороастрийцы 6.9
CAR или пигмеи 6.5
Южная Корея (2) 6.5
Швеция 6.1
Нидерланды 5,6
Уганда Муганда Баганда 5,3
Ливан Ниха эль Шуфф 4.9
Дания 4.6
Франция Ренн 4.6
Израиль Газа палестинцы 3.9
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ 3.8
Алжир1 3.5
Россия Северо-Запад славянский 3.5
Англия европеоид 3.1
Немецкий Эссен 2,6
Чехия 2,4
Греция 2.0
Индия Дели 1,8
Науру 1.5
Финляндия 1.4
Гамбия 0,7

DQB1 * 0604

DQB1 * 0604 встречается на более высоких частотах в некоторых частях Африки и Азии и связан почти исключительно с DQA1 * 0102 как 6.4 . Этот гаплотип наиболее часто встречается в Евразии в Японии.

HLA DQB1 * 0609 частоты
частота
исх. численность населения (%)
Руанда Кигали Хуту и ​​Тутси 5,7
Кения 5,3
Уганда Муганда Баганда 5,3
Конго Киншаса Банту 4.4
Гамбия 4.4
Монголия Цаатан 4.2
Южная Корея (3) 3,7
Камерун Саа 3.5
Словения 3.0
Тунис 3.0
Зимбабве Хараре Шона 2.2
Вьетнам Ханой Кинь 2.0
Нидерланды 1,7
Саудовская Аравия Guraiat & Hail 1.6
Алжир Оран 1.5
Греция (2) 1.2
Таиланд (2) 1.2
Тунис Матмата Бербер 1.2
Италия Рим 1.0
Испания Гранада 0,7
Италия Бергамо 0,6
Южная Ирландия 0,2
Китай Урумчи-Уйгурский 0,0
США Аляска коренные жители юпиков 0,0

DQB1 * 0609

DQB1 * 0609 встречается в Африке и ближайших регионах Евразии.

Гаплотипы и болезни

Было обнаружено, что предрасположенность к инфекции лептоспироза связана с недифференцированным DQ6. Тогда как DQ6 защищал от смерти (или необходимости трансплантации печени) при первичном склерозирующем холангите .

DQ6.1

DQA1 * 0103: DQB1 * 0601 (DQ6.1) встречается с повышенными частотами в Азии и почти отсутствует в Западной Европе. Он обеспечивает защиту от нарколепсии , ювенильного диабета , синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), вульгарной пузырчатки , рассеянного склероза , миастении .

DQ6.2

DQ6.2 (DQA1 * 0102  : DQB1 * 0602 ) обычно связан с DR15 и как таковой является частью гаплотипа HLA B7-DR15-DQ6 . Этот гаплотип считается самым длинным мультигенным гаплотипом, известным в геноме человека, поскольку он охватывает более 4,7 миллиона нуклеотидов. Гаплотип DR15-DQ6.2 является наиболее распространенным гаплотипом DR-DQ в Европе, и примерно 30% американцев несут как минимум DQ6.2. Гаплотип еще более распространен в Средней Азии.

DQ6.2 ассоциации с болезнью

При миастении распознавание α34-49 AChR увеличивалось с DQ6.2. DQA1 * 0102 увеличивает риск рака шейки матки . При рассеянном склерозе DQA1 * 0102 был наиболее частым аллелем, а DQB1 * 0602 значительно увеличивался у пациентов с РС.

Защитные эффекты DQ6.2

При первичном билиарном циррозе DQ6.2 имеет отрицательную связь с заболеванием. DQ6.2 также оказывает защитное действие при ювенильном диабете . DQ6.2 также защищает от детских спазмов у метисов.

DQ6.3

DQ6.3 (DQA1 * 0103  : DQB1 * 0603 ) встречается в северно-центральной Европе с умеренной частотой, он защищает от многих аутоиммунных заболеваний. Он также обеспечивает некоторую защиту от ВИЧ-инфекции.

DQ6.4

DQ6.4 (DQA1 * 0102  : DQB1 * 0604 ) может быть связан с индуцированной тимомой миастенией гравис.

Рекомендации