Хлорофлекси (класс) - Chloroflexi (class)

Хлорофлексия
Научная классификация
Домен:
Тип:
Класс:
Хлорофлексия

Gupta et al. 2013
Заказы и подписки

Herpetosiphonales
Chloroflexales

Синонимы

Хлорофлексия Кастенхольц 2001

Chloroflexia являются одним из шести классов бактерий в филюме Chloroflexi , известный как нитчатые зеленые бактерий без серы . Они используют свет для получения энергии и названы в честь зеленого пигмента, который обычно содержится в фотосинтетических телах, называемых хлоросомами .

Хлорофлексия обычно носит нитчатый характер и может перемещаться через бактериальное скольжение . Они факультативно аэробны , но не производят кислород в процессе производства энергии из света или фототрофии . Кроме того, у хлорофлексии другой метод фототрофии ( фотогетеротрофии ), чем у настоящих фотосинтезирующих бактерий .

Этимология

Название «Chloroflexi» является неолатиновым множественным числом от «Chloroflexus», которое является названием первого описанного рода. Существительное представляет собой комбинацию греческого chloros (χλωρός), означающего «зеленовато-желтый», и латинского flexus (от flecto ), означающего «изогнутый», что означает «зеленый изгиб». Название не связано с хлором, элементом, подтвержденным в 1810 году сэром Хамфри Дэви и названным в честь его бледно-зеленого цвета.

Таксономия и молекулярные подписи

Класс Chloroflexia - это группа глубоко разветвленных фотосинтезирующих бактерий (за исключением видов Herpetosiphon и Kallotenue ), которые в настоящее время состоят из трех отрядов: Chloroflexales , Herpetosiphonales и Kallotenuales . Herpetosiphonales и Kallotenuales каждый состоит из одного рода в пределах своего собственного семейства, Herpetosiphonaceae ( Herpetosiphon ) и Kallotenuaceae ( Kallotenue ), соответственно, тогда как Chloroflexales более разнообразны в филогенетическом отношении.

Микроскопические отличительные характеристики

Члены филума Chloroflexi являются монодермами и окрашивают в основном грамотрицательные, тогда как большинство видов бактерий являются дидермантами и окрашивают грамотрицательные , за исключением грамположительных Firmicutes (низкие грамположительные GC), Actinobacteria (высокие GC, грамположительные) и Группа Deinococcus-Thermus (грамположительные, дидерманы с густым пептидогликаном).

Генетические отличительные характеристики

Сравнительный геномный анализ недавно уточнил таксономию класса Chloroflexia , разделив Chloroflexales на подотряд Chloroflexineae, состоящий из семейств Oscillachloridaceae и Chloroflexaceae , и подотряд Roseiflexineae, содержащий семейство Roseiflexaceae . Пересмотренная таксономия была основана на идентификации ряда консервативных инделей сигнатур (CSI), которые служат в качестве высоконадежных молекулярных маркеров общего происхождения.

Физиологические отличительные характеристики

Дополнительным подтверждением разделения Chloroflexales на два подотряда являются наблюдаемые различия в физиологических характеристиках, где каждый подотряд характеризуется различными профилями каротиноидов , хинонов и жирных кислот , которые постоянно отсутствуют в другом подотряде.

Помимо разграничения таксономических рангов, CSI могут играть роль в уникальных характеристиках членов клады: в частности, вставка из четырех аминокислот в белке пируват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктазу, белке, который играет важную роль в фотосинтезирующих организмах. , был обнаружен исключительно среди всех представителей рода Chloroflexus и, как полагают, играет важную функциональную роль.

Дополнительная работа была проделана с использованием CSI для разграничения филогенетического положения Chloroflexia относительно соседних фотосинтетических групп, таких как Cyanobacteria.

Виды Chloroflexia образуют отдельную линию с видами Chlorobi , их ближайшими филогенетическими родственниками. Было обнаружено, что CSI является общим для членов как Chloroflexia, так и Chlorobi , что было интерпретировано как результат горизонтального переноса генов между двумя родственниками.

Таксономия

В настоящее время принятая таксономия выглядит следующим образом:

Кроме того, «Kouleothrix aurantiaca» и «Dehalobium chlorocoercia» не были полностью описаны.

Рекомендации

дальнейшее чтение

  • Гаррити GM, Холт JG (2001). "Phylum BVI. Chloroflexi phy. Nov" . В Бун, Д. Р., Кастенхольц, Р. В. (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. п.  169 . ISBN   978-0-387-98771-2 .

Внешние ссылки

Внешние ссылки