Хлорофлекси (класс) - Chloroflexi (class)
Хлорофлексия | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Класс: |
Хлорофлексия
Gupta et al. 2013
|
Заказы и подписки | |
Синонимы | |
Хлорофлексия Кастенхольц 2001 |
Chloroflexia являются одним из шести классов бактерий в филюме Chloroflexi , известный как нитчатые зеленые бактерий без серы . Они используют свет для получения энергии и названы в честь зеленого пигмента, который обычно содержится в фотосинтетических телах, называемых хлоросомами .
Хлорофлексия обычно носит нитчатый характер и может перемещаться через бактериальное скольжение . Они факультативно аэробны , но не производят кислород в процессе производства энергии из света или фототрофии . Кроме того, у хлорофлексии другой метод фототрофии ( фотогетеротрофии ), чем у настоящих фотосинтезирующих бактерий .
Этимология
Название «Chloroflexi» является неолатиновым множественным числом от «Chloroflexus», которое является названием первого описанного рода. Существительное представляет собой комбинацию греческого chloros (χλωρός), означающего «зеленовато-желтый», и латинского flexus (от flecto ), означающего «изогнутый», что означает «зеленый изгиб». Название не связано с хлором, элементом, подтвержденным в 1810 году сэром Хамфри Дэви и названным в честь его бледно-зеленого цвета.
Таксономия и молекулярные подписи
Класс Chloroflexia - это группа глубоко разветвленных фотосинтезирующих бактерий (за исключением видов Herpetosiphon и Kallotenue ), которые в настоящее время состоят из трех отрядов: Chloroflexales , Herpetosiphonales и Kallotenuales . Herpetosiphonales и Kallotenuales каждый состоит из одного рода в пределах своего собственного семейства, Herpetosiphonaceae ( Herpetosiphon ) и Kallotenuaceae ( Kallotenue ), соответственно, тогда как Chloroflexales более разнообразны в филогенетическом отношении.
Микроскопические отличительные характеристики
Члены филума Chloroflexi являются монодермами и окрашивают в основном грамотрицательные, тогда как большинство видов бактерий являются дидермантами и окрашивают грамотрицательные , за исключением грамположительных Firmicutes (низкие грамположительные GC), Actinobacteria (высокие GC, грамположительные) и Группа Deinococcus-Thermus (грамположительные, дидерманы с густым пептидогликаном).
Генетические отличительные характеристики
Сравнительный геномный анализ недавно уточнил таксономию класса Chloroflexia , разделив Chloroflexales на подотряд Chloroflexineae, состоящий из семейств Oscillachloridaceae и Chloroflexaceae , и подотряд Roseiflexineae, содержащий семейство Roseiflexaceae . Пересмотренная таксономия была основана на идентификации ряда консервативных инделей сигнатур (CSI), которые служат в качестве высоконадежных молекулярных маркеров общего происхождения.
Физиологические отличительные характеристики
Дополнительным подтверждением разделения Chloroflexales на два подотряда являются наблюдаемые различия в физиологических характеристиках, где каждый подотряд характеризуется различными профилями каротиноидов , хинонов и жирных кислот , которые постоянно отсутствуют в другом подотряде.
Помимо разграничения таксономических рангов, CSI могут играть роль в уникальных характеристиках членов клады: в частности, вставка из четырех аминокислот в белке пируват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктазу, белке, который играет важную роль в фотосинтезирующих организмах. , был обнаружен исключительно среди всех представителей рода Chloroflexus и, как полагают, играет важную функциональную роль.
Дополнительная работа была проделана с использованием CSI для разграничения филогенетического положения Chloroflexia относительно соседних фотосинтетических групп, таких как Cyanobacteria.
Виды Chloroflexia образуют отдельную линию с видами Chlorobi , их ближайшими филогенетическими родственниками. Было обнаружено, что CSI является общим для членов как Chloroflexia, так и Chlorobi , что было интерпретировано как результат горизонтального переноса генов между двумя родственниками.
Таксономия
В настоящее время принятая таксономия выглядит следующим образом:
- Заказать Chloroflexales
- Подотряд Chloroflexineae
-
Семейство Chloroflexaceae Trüper 1976 исправлено. Gupta et al. 2013
- Род Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974 г.
- C. aggregans Hanada et al. 1995 г.
- C. aurantiacus Пирсон и Кастенхольц 1974 г.
- Род Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974 г.
-
Семейство Oscillochloridaceae Keppen 2000 исправить. Gupta et al. 2013
- Род Oscillochloris Горленко и Пивоварова 1989 исправил. Keppen et al. 2000 г.
- О. Хрисея Горленко и Пивоварова 1989
- O. trichoides (ex Szafer) Горленко и Коротков 1989 исправляют. Keppen et al. 2000 г.
- Род Chloronema Dubinina and Gorlenko 1975 г.
- Chloronema giganteum Дубинина и Горленко 1975 г.
- Род Oscillochloris Горленко и Пивоварова 1989 исправил. Keppen et al. 2000 г.
-
Семейство Chloroflexaceae Trüper 1976 исправлено. Gupta et al. 2013
- Подотряд Roseiflexineae
-
Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
- Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
- Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.
- Род Heliothrix Pierson et al. 1986 г.
- Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986 г.
- Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
-
Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
- Подотряд Chloroflexineae
- Орден " Герпетосифоналес "
-
Семья " Herpetosiphonaceae "
- Род Herpetosiphon Holt and Lewin 1968 г.
- H. aurantiacus Холт и Левин, 1968 г.
- H. geysericola (Copeland 1936) Левин 1970
- Род Herpetosiphon Holt and Lewin 1968 г.
-
Семья " Herpetosiphonaceae "
Кроме того, «Kouleothrix aurantiaca» и «Dehalobium chlorocoercia» не были полностью описаны.
Рекомендации
дальнейшее чтение
- Гаррити GM, Холт JG (2001). "Phylum BVI. Chloroflexi phy. Nov" . В Бун, Д. Р., Кастенхольц, Р. В. (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
Внешние ссылки
- Ссылки PubMed на Chloroflexi
- Ссылки PubMed Central для Chloroflexi
- Ссылки Google Scholar для Chloroflexi