Тип - Phylum
В биологии, филюм ( / е aɪ л əm / ; множественное число : фил ) является уровень классификации или таксономического ранга ниже царства и выше класса . Традиционно в ботанике термин « разделение » использовался вместо филума, хотя Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений принимает эти термины как эквивалентные. В зависимости от определений животный мир Animalia содержит приблизительно 31 тип; царство растений Plantae насчитывает около 14, а царство грибов Fungi - около 8 типов. Текущие исследования в области филогенетики раскрывают взаимосвязь между типами, которые содержатся в более крупных кладах , таких как Ecdysozoa и Embryophyta .
Общее описание
Термин тип был придуман в 1866 году Эрнстом Геккелем от греческого слова phylon ( φῦλον , «раса, род»), связанного с филоном ( φυλή , «племя, клан»). Геккель отмечал, что виды постоянно эволюционировали в новые виды, которые, казалось, сохраняли между собой несколько согласованных черт и, следовательно, мало черт, которые отличали их как группу («замкнутое единство»). "Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe Aller Species, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir." что переводится как: Однако, возможно, такое реальное и полностью самодостаточное единство является совокупностью всех видов, которые постепенно эволюционировали из одной и той же общей исходной формы, как, например, все позвоночные. Мы называем эту совокупность [a] Stamm [т. Е. Раса] ( Phylon ). В систематике растений , август W. Eichler (1883) Объявления растений в пять групп , названных подразделений, термин , который остается в использовании сегодня для групп растений, водорослей и грибов. Определения зоологической филы изменились от своих истоков в шести Линнея классов и четырех embranchements от Жоржа Кювье .
Неформально типы можно рассматривать как группы организмов, основанные на общей специализации строения тела . По сути, тип можно определить двумя способами: как группу организмов с определенной степенью морфологического сходства или сходства в развитии ( фенетическое определение) или как группу организмов с определенной степенью эволюционного родства ( филогенетическое определение ). Попытка определить уровень иерархии Линнея без ссылки на (эволюционное) родство неудовлетворительна, но фенетическое определение полезно при решении вопросов морфологического характера, например, насколько успешными были различные планы тела.
Определение, основанное на генетическом родстве
Самая важная объективная мера в приведенных выше определениях - это «определенная степень», которая определяет, насколько разные организмы должны быть членами разных типов. Минимальное требование состоит в том, чтобы все организмы в типе были явно более тесно связаны друг с другом, чем с любой другой группой. Даже это проблематично, потому что требование зависит от знания взаимоотношений организмов: по мере того, как становится доступным больше данных, особенно из молекулярных исследований, мы можем лучше определять отношения между группами. Таким образом, типы могут быть объединены или разделены, если станет очевидно, связаны они друг с другом или нет. Например, бородатые черви были описаны как новый тип (Pogonophora) в середине 20-го века, но молекулярная работа почти полвека спустя обнаружила, что они представляют собой группу кольчатых червей , поэтому эти типы были объединены (бородатые черви теперь семья кольчатых червей ). С другой стороны, весьма паразитарные филюмы мезозои были разделены на две филы ( ортонектида и Rhombozoa ) , когда она была обнаружена ортонектида, вероятно , вторичноротый и Rhombozoa первичноротого .
Эта изменчивость типов привела к тому, что некоторые биологи призвали отказаться от концепции типа в пользу кладистики - метода, при котором группы помещаются на «генеалогическое древо» без какого-либо формального ранжирования размера группы.
Определение на основе плана тела
Определение типа, основанное на плане тела, было предложено палеонтологами Грэмом Баддом и Сереном Йенсеном (как это сделал Геккель столетием раньше). Это определение было предложено потому, что вымершие организмы сложнее всего классифицировать: они могут быть ответвлениями, которые отклонились от линии типа до того, как были приобретены все признаки, определяющие современный тип. По определению Бадда и Дженсена тип определяется набором символов, общих для всех его живых представителей.
Такой подход порождает некоторые небольшие проблемы - например, наследственные признаки, общие для большинства членов филума, могли быть потеряны некоторыми членами. Кроме того, это определение основано на произвольном моменте времени: настоящем. Однако, поскольку он основан на символах, его легко применить к летописи окаменелостей. Более серьезная проблема состоит в том, что он основан на субъективном решении о том, какие группы организмов следует рассматривать как типы.
Этот подход полезен, поскольку он позволяет легко классифицировать вымершие организмы как « стеблевые группы » по типу, с которым они имеют наибольшее сходство, основываясь только на таксономически важных сходствах. Однако доказать, что окаменелость принадлежит к группе короны типа, сложно, поскольку она должна отображать характер, уникальный для подмножества группы короны. Более того, организмы в группе ствола типа могут обладать «планом тела» этого типа без всех характеристик, необходимых для того, чтобы в него входить. Это ослабляет представление о том, что каждый тип представляет собой отдельный план тела.
На классификацию, использующую это определение, может сильно повлиять вероятность выживания редких групп, что может сделать тип намного более разнообразным, чем он был бы в противном случае.
Известный тип
Животные
Общие числа являются приблизительными; цифры разных авторов сильно различаются, не в последнюю очередь потому, что некоторые из них основаны на описанных видах, а некоторые - на экстраполяциях на количество неописанных видов. Например, описано около 25 000–27 000 видов нематод, в то время как опубликованные оценки общего числа видов нематод включают 10 000–20 000 видов; 500 000; 10 миллионов; и 100 миллионов.
Протостом | Bilateria | |
Deuterostome | ||
Базальный / спорный | ||
Другие |
Тип | Имея в виду | Распространенное имя | Отличительная характеристика | Описанные виды |
---|---|---|---|---|
Аннелида | Маленькое кольцо | Сегментированные черви | Множественные круглые сегменты | 22000 + существующих |
Членистоногие | Сочлененная стопа | Членистоногие | Сегментированные тела и сочлененные конечности с экзоскелетом из хитина | 1,250,000 + существующие; 20,000+ вымерших |
Брахиоподы | Рука нога | Патроны | Лофофор и ножка | 300 -500 сохранилось; 12000+ вымерших |
Мшанки ( Ectoprocta ) | Моховые животные | Моховые животные, морские циновки, эктопрокты | Лофофор, без ножки, ресничные щупальца , анус за пределами кольца ресничек | 6000 сохранившихся |
Chaetognatha | Длинношерстная челюсть | Черви-стрелы | Хитиновые шипы по бокам головы, плавники | ок. 100 сохранившихся |
Хордовые | Со шнуром | Хордовые | Полые спинной нерв шнур , хорда , глоточные щели , endostyle , пост- анальный хвост | ок. 55 000+ |
Книдария | Крапива | Книдарианцы | Нематоцисты (жалящие клетки) | ок. 16 000 |
Гребневик | Гребешок | Гребешки | Восемь «гребенчатых рядов» сросшихся ресничек | ок. 100 -150 сохранилось |
Циклиофора | Колесо для переноски | Симбион | Круглый рот, окруженный маленькими ресничками, мешковидными телами | 3 + |
Иглокожие | Колючая кожа | Иглокожие | Пятикратная радиальная симметрия у живых форм, мезодермальные кальцинированные шипы | ок. 7 500 сохранившихся; ок. 13000 вымерших |
Энтопрокта | Внутри ануса | Кубковые черви | Анус внутри кольца ресничек | ок. 150 |
Гастротрича | Волосатый живот | Гастротриховые черви | Две клеммные клейкие трубки | ок. 690 |
Гнатостомулида | Отверстие челюсти | Челюстные черви | ок. 100 | |
Hemichordata | Половина шнур | Желудевые черви, полухордовые | Стомохорд в воротнике, глоточные прорези | ок. 130 сохранились |
Киноринча | Движение морды | Грязевые драконы | Одиннадцать сегментов, каждый с дорсальной пластиной | ок. 150 |
Лорицифера | Носитель корсета | Насадки для щеток | Зонтичные чешуйки на каждом конце | ок. 122 |
Микрогнатозоа | Крошечные челюсти животных | Лимногнатия | Растяжимая грудная клетка в виде гармошки | 1 |
Моллюска | Мягкий | Моллюски / моллюски | Мускулистая ступня и мантия, круглая оболочка | 85000 + существующих; 80,000+ вымерших |
Нематода | Тема нравится | Круглые черви, резьбовые черви | Круглое сечение, кератиновая кутикула | 25 000 |
Нематоморфа | Форма резьбы | Черви конского волоса, гордиевые черви | ок. 320 | |
Немертя | Морская нимфа | Ленточные черви, ринхоцели | ок. 1,200 | |
Онихофора | Коготь | Бархатные черви | Ноги с хитиновыми когтями | ок. 200 сохранившихся |
Phoronida | Любовница Зевса | Подковообразные черви | U-образная кишка | 11 |
Placozoa | Тарелка животные | Трихоплаксы | Дифференцированная верхняя и нижняя поверхности, два слоя реснитчатых клеток, клетки амебоидных волокон между ними | 3 |
Платигельминты | Плоский червь | Плоские черви | ок. 29 500 | |
Porifera | Носитель поры | Губки | Перфорированная внутренняя стена | 10,800 дошедших до нас |
Приапулида | Маленький Приап | Черви на пенисе | ок. 20 | |
Ромбозоа ( Dicyemida ) | Леденец животное | Ромбозойные | Одиночная переднезадняя осевая клетка, окруженная ресничными клетками | 100 + |
Коловратка | Подшипник колеса | Коловратки | Передняя коронка ресничек | ок. 2 000 |
Тихоходка | Медленный шаг | Водяные медведи, Моховые поросята | Четыре сегмента тела и головы | 1,000 |
Xenacoelomorpha | Странная полая форма | Акоэлы, ксенотурбеллиды | Двусторонний , но без типичных двусторонних структур, таких как полости кишечника, анусы и системы кровообращения | 400 + |
Итого: 31 | 1 525 000 |
Растения
Царство Plantae определяется разными биологами по-разному (см. Текущие определения Plantae ). Все определения включают живые эмбриофиты (наземные растения), к которым можно добавить два подразделения зеленых водорослей, Chlorophyta и Charophyta , чтобы сформировать кладу Viridiplantae . Приведенная ниже таблица следует за влиятельной (хотя и спорной) системой Кавальера-Смита, приравнивающей Plantae к Archaeplastida , группе, содержащей Viridiplantae и подразделения водорослей Rhodophyta и Glaucophyta .
Определение и классификация растений на уровне подразделения также различаются от источника к источнику и постепенно меняются в последние годы. Таким образом, некоторые источники помещают хвощи в подразделение Arthrophyta, а папоротники в подразделение Monilophyta, в то время как другие помещают их оба в подразделение Monilophyta, как показано ниже. Подразделение Pinophyta может использоваться для всех голосеменных растений (т. Е. Включая саговники, гинкго и гнетофиты) или только для хвойных растений, как показано ниже.
С момента первой публикации системы APG в 1998 г., в которой предлагалась классификация покрытосеменных растений до уровня порядков , многие источники предпочли рассматривать ранги выше, чем порядки, как неформальные клады. Там, где были предоставлены формальные ранги, перечисленные ниже традиционные подразделения были сокращены до гораздо более низкого уровня, например, подклассы .
Наземные растения | Виридипланты | |
Зеленые водоросли | ||
Другие водоросли ( Biliphyta ) |
Разделение | Имея в виду | Распространенное имя | Отличительные характеристики | Описанные виды |
---|---|---|---|---|
Anthocerotophyta | Антоцероподобные растения | Роголистники | Роговидные спорофиты , без сосудистой системы | 100 -300+ |
Мохообразные | Брюмоподобные растения, моховые растения | Мхи | Стойкие неразветвленные спорофиты , без сосудистой системы | ок. 12 000 |
Чарофита | Чара -как растения | Харофиты | ок. 1,000 | |
Хлорофита | (Желто-) зеленые растения | Хлорофиты | ок. 7 000 | |
Cycadophyta | Cycas -подобных растений, пальмовоекак растения | Саговники | Семена, крона сложных листьев | ок. 100 -200 |
Гинкгофита | Гинкго- подобные растения | Гинкго, девичье дерево | Семена, не защищенные плодами (одиночные живые виды) | сохранился только 1 ; 50+ вымерших |
Глаукофита | Сине-зеленые растения | Глаукофиты | 15 | |
Гнетофита | Гнетумоподобные растения | Гнетофиты | Семена и древесная сосудистая система с сосудами | ок. 70 |
Lycopodiophyta , |
Lycopodium- подобные растения Волчьи растения |
Косолапости и колючки | Листья микрофилла , сосудистая система | 1290 сохранившихся |
Магнолиофита | Magnolia -как растения | Цветковые растения, покрытосеменные | Цветы и фрукты, сосудистая система с сосудами | 300 000 |
Marchantiophyta , Гепатофита |
Маршанция- подобные растения Печеночные растения |
Печеночники | Эфемерные неразветвленные спорофиты , без сосудистой системы | ок. 9 000 |
Полиподиофита , |
Полиподиумоподобные растения |
Папоротники | Листья мегафилла , сосудистая система | ок. 10 560 |
Pinophyta , Coniferophyta |
Pinus -как растения Конусный завод |
Хвойные | Шишки, содержащие семена и древесину, состоящую из трахеид | 629 дошедших до нас |
Родофита | Розовые растения | Красные водоросли | Используйте фикобилипротеины в качестве дополнительных пигментов . | ок. 7 000 |
Итого: 14 |
Грибы
Разделение | Имея в виду | Распространенное имя | Отличительные характеристики | Описанные виды |
---|---|---|---|---|
Аскомикота | Грибок мочевого пузыря | Аскомицеты, мешочные грибки | Имеют плодовые тела (аскокарпий). Нитчатые, образующие гифы, разделенные перегородками. Может размножаться бесполым путем. | 30 000 |
Базидиомицеты | Мелкослойный грибок | Базидиомицеты, клубные грибы | Грибковые грибы, поганки, грязь и ржавчина. Половое размножение. | 31 515 |
Blastocladiomycota | Ветвистый грибок | Бластоклады | Менее 200 | |
Chytridiomycota | Маленький грибок для кастрюли | Читриды | Преимущественно водные сапротрофные или паразитические. Имеют задний жгутик . Обычно одноклеточные, но могут быть и многоклеточные. | 1000+ |
Гломеромикота | Клубок пряжи грибок | Гломеромицеты, грибы AM | В основном присутствуют арбускулярные микоризы, наземные, в небольшом количестве присутствуют на заболоченных территориях. Размножение бесполое, но требует корней растений. | 284 |
Микроспоридии | Мелкие семена | Microsporans | 1400 | |
Neocallimastigomycota | Новый красивый плетеный грибок | Неокаллимастигомицеты | Преимущественно находится в пищеварительном тракте травоядных животных. Анаэробные, наземные и водные. | ок. 20 |
Zygomycota | Парный грибок | Зигомицеты | Большинство из них являются сапробионтами и размножаются половым и бесполым путем. | ок. 1060 |
Итого: 8 |
Тип Microsporidia обычно входит в состав королевства Fungi, хотя его точные отношения остаются неясными, и Международное общество протистологов считает его простейшим (см. Protista ниже). Молекулярный анализ Zygomycota показал, что он полифилетичен (его представители не имеют прямого предка), что многие биологи считают нежелательным. Соответственно, есть предложение об упразднении филума Zygomycota. Его члены будут разделены между типом Glomeromycota и четырьмя новыми подтипами incertae sedis (неопределенное местонахождение ): Entomophthoromycotina , Kickxellomycotina , Mucoromycotina и Zoopagomycotina .
Протиста
Королевство Protista (или Protoctista) входит в традиционной модели пяти- или шести-королевство, где он может быть определен как содержащий все эукариоты , которые не являются растения, животные или грибы. Протиста - это полифилетический таксон, который для современных биологов менее приемлем, чем в прошлом. Были сделаны предложения разделить его между несколькими новыми царствами, такими как Protozoa и Chromista в системе Кавальера-Смита .
Таксономия протистов долгое время была нестабильной: разные подходы и определения привели к появлению множества конкурирующих классификационных схем. Перечисленные здесь типы используются для Chromista и Protozoa в « Каталоге жизни» , адаптированном из системы, используемой Международным обществом протистологов.
Harosa | |
Простейшие |
Тип / Отдел | Имея в виду | Распространенное имя | Отличительные характеристики | Пример | Описанные виды |
---|---|---|---|---|---|
Амебозоа | Аморфное животное | Амебы | Наличие псевдоподий | Амеба | 2400 |
Bigyra | Два кольца | ||||
Cercozoa | |||||
Хоанозоа | Воронка для животных | Наличие воротника из микроворсинок, окружающих жгутик. | 125 | ||
Цилиофора | Реснички носитель | Инфузории | Наличие множественных ресничек и цитостома | Парамеций | 4500 |
Криптиста | Скрытый | ||||
Эвгленозоа | Настоящее глазное животное | Эвглена | 800 | ||
Фораминиферы | Носители отверстий | Форамы | Сложные оболочки с одной или несколькими камерами | Форамы | 10000, 50000 вымерших |
Гаптофита | |||||
Лукозоа | Грув животное | ||||
Метамонада | Средние одноклеточные организмы | Лямблии | |||
Микроспоридии | Мелкая спора | ||||
Myzozoa | Грудное животное | 1555+ | |||
Охрофита | Желтое растение | Диатомеи | |||
Oomycota | Яичный грибок | Оомицеты | |||
Перколозоа | |||||
Радиозоа | Рэй животное | Радиолярии | |||
Саркомастигофора | Носитель плоти и кнута | ||||
Sulcozoa | |||||
Всего: 19 |
Каталог жизни включает Rhodophyta и Glaucophyta в царстве Plantae, но в других системах эти типы считаются частью Protista.
Бактерии
В настоящее время существует 29 типов, принятых в Списке имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN).
- Ацидобактерии , фенотипически разнообразные и в основном некультивируемые
- Актинобактерии , грамположительные виды с высоким содержанием G + C
- Aquificae , всего 14 теплолюбивых родов, глубокое ветвление
- Арматимонадеты
- Bacteroidetes
- Caldiserica , бывший кандидат подразделения OP5, Caldisericum exile является единственным представителем
- Хламидии , всего 6 родов
- Chlorobi , всего 7 родов, зеленые серные бактерии
- Chloroflexi , зеленые несернистые бактерии
- Chrysiogentes , всего 3 рода ( Chrysiogenes arsenatis , Desulfurispira natronophila , Desulfurispirillum alkaliphilum )
- Цианобактерии , также известные как сине-зеленые водоросли.
- Deferribacteres
- Deinococcus-Thermus , Deinococcus radiodurans и Thermus aquaticus являются «общеизвестными» видами этого типа.
- Диктиогломи
- Elusimicrobia , ранее кандидат в подразделение Thermite Group 1
- Фибробактерии
- Firmicutes , грамположительные виды с низким содержанием G + C, такие как спорообразующие бациллы (аэробные) и клостридии (анаэробные)
- Фузобактерии
- Гемматимонадес
- Lentisphaerae , ранее клады VadinBE97
- Нитроспира
- Планктомицеты
- Протеобактерии , наиболее известные типы, содержащие такие виды, как Escherichia coli или Pseudomonas aeruginosa.
- Спирохеты , виды включают Borrelia burgdorferi , вызывающую болезнь Лайма.
- Synergistetes
- Tenericutes , альтернативно класс Mollicutes в типе Firmicutes (известный род: Mycoplasma )
- Термодесульфобактерии
- Термотоги , глубокое ветвление
- Веррукомикробия
Архей
В настоящее время существует пять типов, принятых в Списке имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN).
- Crenarchaeota , второй по распространенности тип архей
- Euryarchaeota , наиболее распространенный тип архей
- Корархеота
- Наноархеи , сверхмалые симбиоты, единичные известные виды
- Таумархеота