Цифровая автоматизированная система идентификации - Digital Automated Identification System
Разработчики) | Марк А. О'Нил |
---|---|
Стабильный выпуск | 2.1.0 / 1 февраля 2016 г .
|
Написано в | C |
Операционная система | Linux |
Платформа | IA-32 x86-64 ARM |
Доступно в | английский |
Лицензия | Проприетарное коммерческое программное обеспечение |
Интернет сайт | www |
Цифровая автоматизированная система идентификации (DAISY) - это автоматизированная система идентификации видов, оптимизированная для быстрого скрининга беспозвоночных (например, насекомых) неспециалистами (например, паратаксономистами ).
Он был разработан доктором Марком О'Нилом в середине 1990-х годов. Развитие поддерживалось финансированием Дарвиновской инициативы в 1997 году и BBSRC . В области прав интеллектуальной собственности , были приобретены компанией О'Нила, кувыркаясь Dice Ltd, в феврале 2000 года в конце гранта , финансируемого Darwin проекта . Система подверглась дальнейшему развитию, в результате чего был создан образец, доступный в сети и способный справляться почти в реальном времени с группами (например, ястребиными молью ), содержащими несколько сотен таксонов . На аппаратном обеспечении ПК среднего и высокого уровня (например, блейд-сервере ) для группы из 300 таксонов возможна идентификация менее чем за секунду. Распараллеливание критических кодов классификатора DAISY (с использованием либо специальной технологии FPGA, либо технологии программирования общего назначения на GPU, такой как CUDA ) даст увеличение производительности на порядок. Это означает, что DAISY можно использовать для идентификации в реальном времени внутри групп, содержащих тысячи таксонов (например, настоящих мух ).
таксон | тип изображения | структура | обучающие изображения | виды | успех (%) |
---|---|---|---|---|---|
Белизские сфингиды | RGB | крыло | 705 | 58 | 97 |
Xylophanes sp. | RGB | крыло | 543 | 30 | 99 |
Паразитические осы | мононуклеоз | крыло | 559 | 47 | 95 |
Бабочки Великобритании | RGB | крыло | 818 | 57 | 98 |
Великобритания макромоль | RGB | крыло | 744 | 37 | 98 |
Гусеницы | RGB | глава | 91 | 7 | 93 |
Гусеницы | RGB | тело | 508 | 10 | 99 |
Вредители мягких фруктов | RGB | тело | 2634 | 23 | 91 |
описание | тип изображения | структура | обучающие изображения | классы | успех (%) |
---|---|---|---|---|---|
Консервные банки | RGB | метка | 31 год | 5 | 100 |
Промышленные объекты | RGB | неоткрытый объект | 155 | 14 | 100 |
Тесты фораминифер | RGB | неоткрытый объект | 198 | 8 | 95 |
Пыльцевые зерна | RGB | неоткрытый объект | 6601 | 12 | 99 |
Пауки | мононуклеоз | гениталии | 102 | 6 | 91 |
Человеческие лица | мононуклеоз | неприкрытое лицо | 400 | 41 год | 99 |
DAISY использовался в нескольких исследовательских проектах О'Нила и других, а также в научно-популярных статьях на телевидении и в журналах. Этот проект также был предметом недавней статьи в Science .
В 2011 году первая установка DAISY, способная масштабироваться до сотен таксонов, была установлена в Музее естественной истории в Лондоне. Этот сервер предлагал интерфейсы на основе как VNC, так и веб-сервисов и мог переносить интенсивные вычисления по сопоставлению с образцом на графический процессор NVIDIA, запрограммированный с использованием CUDA . Эта установка была способна идентифицировать виды с учетом набора данных из 300+ таксонов менее чем за секунду в среде с несколькими пользователями.
Совсем недавно, при финансовой поддержке Innovate UK , DAISY был значительно модифицирован для удовлетворения потребностей разведки и добычи в нефтегазовом секторе, в частности биостратиграфии . Полученная в результате система GeoDAISY представляет собой значительный технологический прогресс. Он поддерживает глубокое обучение , инкапсуляцию знаний, интеллектуальный анализ данных на основе шаблонов и (на основе изображений) поиск контента и может эффективно обрабатывать обучающие наборы, состоящие из миллионов шаблонов, на стандартном оборудовании с использованием комбинации интеллектуального кэширования данных и OpenMP . Дополнительные сведения о GeoDAISY и обоснование его разработки доступны в виде официальных документов на странице Tumbling Dice в LinkedIn .
Смотрите также
- Leafsnap
- iPflanzen
- PlantNet
- Растения (программное обеспечение)
- Плантатор
- NatureGate