Дезоксирибоза - Deoxyribose

d- дезоксирибоза
D-dexoyribose chain.png
D-Deoxyribose.png
Цепочка D-дезоксирибозы-3D-balls.png
D-дезоксирибоза-3D-balls.png
Имена
Название ИЮПАК
2-дезокси- д- рибоза
Другие имена
2-дезокси д - эритро -pentose
thyminose
Идентификаторы
3D модель ( JSmol )
ЧЭБИ
ChemSpider
Номер ЕС
UNII
  • InChI = 1S / C5H10O4 / c6-2-1-4 (8) 5 (9) 3-7 / h2,4-5,7-9H, 1,3H2 / t4-, 5 + / m0 / s1  проверить Y
    Ключ: ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N  проверить Y
  • InChI = 1 / C5H10O4 / c6-2-1-4 (8) 5 (9) 3-7 / h2,4-5,7-9H, 1,3H2 / t4-, 5 + / m0 / s1
    Ключ: ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQBK
  • C (C = O) [C @@ H] ([C @@ H] (CO) O) O
Характеристики
С 5 Н 10 О 4
Молярная масса 134,131  г · моль -1
Внешность Белое твердое вещество
Температура плавления 91 ° С (196 ° F, 364 К)
Очень растворим
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
проверить Y   проверить  ( что есть    ?) проверить Y ☒ N
Ссылки на инфобоксы

Дезоксирибоза , или, точнее, 2-дезоксирибоза , представляет собой моносахарид с идеализированной формулой H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H. Его название указывает на то, что это дезоксисахар , что означает, что он получен из сахарной рибозы путем потери атома кислорода . Дезоксирибоза наиболее известна своим присутствием в ДНК . Поскольку пентозные сахара, арабиноза и рибоза различаются только стереохимией на C2 ', 2-дезоксирибоза и 2-дезоксиарабиноза эквивалентны, хотя последний термин используется редко, поскольку предшественником дезоксирибозы является рибоза, а не арабиноза.

История

Дезоксирибоза была открыта в 1929 году Фебусом Левеном .

Структура

Существует несколько изомеров с формулой H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H, но в дезоксирибозе все гидроксильные группы находятся на одной стороне в проекции Фишера . Термин «2-дезоксирибоза» может относиться к одному из двух энантиомеров : биологически важный д -2-дезоксирибоза и к редко встречаются зеркальное изображение л -2-дезоксирибозе . d -2-дезоксирибоза является предшественником ДНК нуклеиновой кислоты . 2-дезоксирибоза представляет собой альдопентозу , то есть моносахарид с пятью атомами углерода и имеющий функциональную альдегидную группу .

В водном растворе дезоксирибоза в основном существует в виде смеси трех структур: линейной формы H- (C = O) - (CH 2 ) - (CHOH) 3 -H и двух кольцевых форм дезоксирибофуранозы («C3'-эндо»). , с пятичленным кольцом и дезоксирибопираноза («C2'-эндо») с шестичленным кольцом. Последняя форма является преобладающей (тогда как C3'-эндо-форма предпочтительна для рибозы).

Химическое равновесие дезоксирибозы в растворе

Биологическое значение

Как компонент ДНК, производные 2-дезоксирибозы играют важную роль в биологии. Молекула ДНК (дезоксирибонуклеиновой кислоты), которая является основным хранилищем генетической информации в жизни, состоит из длинной цепи дезоксирибозосодержащих единиц, называемых нуклеотидами , связанных через фосфатные группы. В стандартной номенклатуре нуклеиновых кислот нуклеотид ДНК состоит из молекулы дезоксирибозы с органическим основанием (обычно аденином , тимином , гуанином или цитозином ), присоединенным к 1 'атому углерода рибозы. 5'-гидроксил каждого дезоксирибозного звена заменен фосфатом (образуя нуклеотид ), который присоединен к 3'-атому углерода дезоксирибозы в предыдущем звене.

Отсутствие 2'- гидроксильной группы в дезоксирибозе, по-видимому, ответственно за повышенную механическую гибкость ДНК по сравнению с РНК, что позволяет ей принимать конформацию двойной спирали, а также (у эукариот ) компактно свертываться в маленькой клетке. ядро . Молекулы двухцепочечной ДНК также обычно намного длиннее, чем молекулы РНК. Основа РНК и ДНК структурно схожи, но РНК одноцепочечная и состоит из рибозы, а не из дезоксирибозы.

Другие биологически важные производные дезоксирибозы включают моно-, ди- и трифосфаты, а также 3'-5 'циклические монофосфаты.

Биосинтез

Дезоксирибоза образуется из рибозо-5-фосфата ферментами, называемыми рибонуклеотидредуктазами . Эти ферменты катализируют процесс деоксигенации.

Рекомендации