«Атлетико Мадрид» впервые собрал женскую команду в конце 1980-х годов. Они выиграли национальную лигу в 1990 году и стали вторыми в следующем году, но, как и гандбольная команда «Атлетико» , они были распущены в начале 1990-х. Большинство игроков присоединились к CD Oroquieta Villaverde , которая стала одной из ведущих команд Испании.
Команда была воссоздана в 2001 году, хотя она не стала официальной частью клуба до 2005 года. После трех сезонов в региональных лигах, в период с 2004 по 2006 год Атлетико заработал два последовательных повышения, чтобы попасть в высшую категорию. Быстро закрепившись в верхней половине таблицы, в 2009–10 годах они заняли четвертое место.
20 мая 2017 года «Атлетико» завоевал титул, победив « Реал Сосьедад» в последнем раунде со счетом 2–1. Colchoneras закончил сезон без потерь.
В марте 2019 года клуб побил европейский рекорд посещаемости женского футбольного матча с 60 739 зрителями на стадионе Метрополитано в матче лиги , проиграв ФК Барселоне 2: 0 (побив рекорд, установленный несколькими месяцами ранее Атлетиком Бильбао , в матче Кубка Рейна против Атлетико).
Примечание. Флажки обозначают национальную команду в соответствии с правилами отбора ФИФА . Игроки могут иметь более одного гражданства, не входящего в ФИФА.
Примечание. Флажки обозначают национальную команду в соответствии с правилами отбора ФИФА . Игроки могут иметь более одного гражданства, не входящего в ФИФА.